Protein–RNA interactions for Protein: Q96NU1

SAMD11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD11Q96NU1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SAMD11Q96NU1 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SAMD11Q96NU1 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SAMD11Q96NU1 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SAMD11Q96NU1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SAMD11Q96NU1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SAMD11Q96NU1 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SAMD11Q96NU1 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SAMD11Q96NU1 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SAMD11Q96NU1 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SAMD11Q96NU1 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SAMD11Q96NU1 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SAMD11Q96NU1 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SAMD11Q96NU1 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SAMD11Q96NU1 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SAMD11Q96NU1 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SAMD11Q96NU1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SAMD11Q96NU1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SAMD11Q96NU1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SAMD11Q96NU1 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SAMD11Q96NU1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SAMD11Q96NU1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SAMD11Q96NU1 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SAMD11Q96NU1 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SAMD11Q96NU1 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SAMD11Q96NU1 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SAMD11Q96NU1 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SAMD11Q96NU1 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SAMD11Q96NU1 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SAMD11Q96NU1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SAMD11Q96NU1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SAMD11Q96NU1 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SAMD11Q96NU1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SAMD11Q96NU1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SAMD11Q96NU1 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SAMD11Q96NU1 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SAMD11Q96NU1 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SAMD11Q96NU1 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SAMD11Q96NU1 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SAMD11Q96NU1 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SAMD11Q96NU1 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SAMD11Q96NU1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SAMD11Q96NU1 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SAMD11Q96NU1 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SAMD11Q96NU1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SAMD11Q96NU1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SAMD11Q96NU1 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SAMD11Q96NU1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SAMD11Q96NU1 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SAMD11Q96NU1 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SAMD11Q96NU1 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SAMD11Q96NU1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SAMD11Q96NU1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SAMD11Q96NU1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SAMD11Q96NU1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SAMD11Q96NU1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SAMD11Q96NU1 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SAMD11Q96NU1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SAMD11Q96NU1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SAMD11Q96NU1 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SAMD11Q96NU1 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SAMD11Q96NU1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SAMD11Q96NU1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SAMD11Q96NU1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SAMD11Q96NU1 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SAMD11Q96NU1 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SAMD11Q96NU1 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SAMD11Q96NU1 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SAMD11Q96NU1 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SAMD11Q96NU1 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SAMD11Q96NU1 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SAMD11Q96NU1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SAMD11Q96NU1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SAMD11Q96NU1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SAMD11Q96NU1 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SAMD11Q96NU1 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SAMD11Q96NU1 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SAMD11Q96NU1 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SAMD11Q96NU1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SAMD11Q96NU1 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SAMD11Q96NU1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SAMD11Q96NU1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SAMD11Q96NU1 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SAMD11Q96NU1 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SAMD11Q96NU1 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SAMD11Q96NU1 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SAMD11Q96NU1 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SAMD11Q96NU1 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SAMD11Q96NU1 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SAMD11Q96NU1 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SAMD11Q96NU1 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SAMD11Q96NU1 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SAMD11Q96NU1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SAMD11Q96NU1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SAMD11Q96NU1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SAMD11Q96NU1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SAMD11Q96NU1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SAMD11Q96NU1 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SAMD11Q96NU1 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SAMD11Q96NU1 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.6 ms