Protein–RNA interactions for Protein: Q96NR8

RDH12, Retinol dehydrogenase 12, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH12Q96NR8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RDH12Q96NR8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RDH12Q96NR8 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RDH12Q96NR8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RDH12Q96NR8 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
RDH12Q96NR8 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RDH12Q96NR8 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RDH12Q96NR8 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RDH12Q96NR8 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RDH12Q96NR8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RDH12Q96NR8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
RDH12Q96NR8 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RDH12Q96NR8 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RDH12Q96NR8 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RDH12Q96NR8 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RDH12Q96NR8 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RDH12Q96NR8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RDH12Q96NR8 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RDH12Q96NR8 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RDH12Q96NR8 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RDH12Q96NR8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RDH12Q96NR8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RDH12Q96NR8 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RDH12Q96NR8 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RDH12Q96NR8 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RDH12Q96NR8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RDH12Q96NR8 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RDH12Q96NR8 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RDH12Q96NR8 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RDH12Q96NR8 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RDH12Q96NR8 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RDH12Q96NR8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RDH12Q96NR8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RDH12Q96NR8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RDH12Q96NR8 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RDH12Q96NR8 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RDH12Q96NR8 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RDH12Q96NR8 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RDH12Q96NR8 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RDH12Q96NR8 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RDH12Q96NR8 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RDH12Q96NR8 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RDH12Q96NR8 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RDH12Q96NR8 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RDH12Q96NR8 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RDH12Q96NR8 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RDH12Q96NR8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RDH12Q96NR8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RDH12Q96NR8 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RDH12Q96NR8 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RDH12Q96NR8 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RDH12Q96NR8 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RDH12Q96NR8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RDH12Q96NR8 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RDH12Q96NR8 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RDH12Q96NR8 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RDH12Q96NR8 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RDH12Q96NR8 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RDH12Q96NR8 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RDH12Q96NR8 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RDH12Q96NR8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RDH12Q96NR8 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RDH12Q96NR8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RDH12Q96NR8 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RDH12Q96NR8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RDH12Q96NR8 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RDH12Q96NR8 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RDH12Q96NR8 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RDH12Q96NR8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RDH12Q96NR8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RDH12Q96NR8 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RDH12Q96NR8 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RDH12Q96NR8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RDH12Q96NR8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RDH12Q96NR8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RDH12Q96NR8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RDH12Q96NR8 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RDH12Q96NR8 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RDH12Q96NR8 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RDH12Q96NR8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RDH12Q96NR8 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RDH12Q96NR8 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RDH12Q96NR8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RDH12Q96NR8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RDH12Q96NR8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
RDH12Q96NR8 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RDH12Q96NR8 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RDH12Q96NR8 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RDH12Q96NR8 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RDH12Q96NR8 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RDH12Q96NR8 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RDH12Q96NR8 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RDH12Q96NR8 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RDH12Q96NR8 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RDH12Q96NR8 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RDH12Q96NR8 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RDH12Q96NR8 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RDH12Q96NR8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RDH12Q96NR8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
RDH12Q96NR8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms