Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA8

TSNARE1, t-SNARE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1Q96NA8 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TSNARE1Q96NA8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TSNARE1Q96NA8 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TSNARE1Q96NA8 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TSNARE1Q96NA8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TSNARE1Q96NA8 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TSNARE1Q96NA8 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TSNARE1Q96NA8 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TSNARE1Q96NA8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TSNARE1Q96NA8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TSNARE1Q96NA8 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TSNARE1Q96NA8 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TSNARE1Q96NA8 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TSNARE1Q96NA8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TSNARE1Q96NA8 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TSNARE1Q96NA8 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TSNARE1Q96NA8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TSNARE1Q96NA8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TSNARE1Q96NA8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TSNARE1Q96NA8 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TSNARE1Q96NA8 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TSNARE1Q96NA8 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TSNARE1Q96NA8 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TSNARE1Q96NA8 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TSNARE1Q96NA8 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TSNARE1Q96NA8 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TSNARE1Q96NA8 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TSNARE1Q96NA8 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TSNARE1Q96NA8 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TSNARE1Q96NA8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TSNARE1Q96NA8 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TSNARE1Q96NA8 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TSNARE1Q96NA8 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TSNARE1Q96NA8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TSNARE1Q96NA8 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TSNARE1Q96NA8 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TSNARE1Q96NA8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TSNARE1Q96NA8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TSNARE1Q96NA8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TSNARE1Q96NA8 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TSNARE1Q96NA8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TSNARE1Q96NA8 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TSNARE1Q96NA8 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TSNARE1Q96NA8 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TSNARE1Q96NA8 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TSNARE1Q96NA8 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TSNARE1Q96NA8 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TSNARE1Q96NA8 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TSNARE1Q96NA8 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TSNARE1Q96NA8 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TSNARE1Q96NA8 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TSNARE1Q96NA8 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TSNARE1Q96NA8 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TSNARE1Q96NA8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TSNARE1Q96NA8 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TSNARE1Q96NA8 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TSNARE1Q96NA8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TSNARE1Q96NA8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TSNARE1Q96NA8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TSNARE1Q96NA8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TSNARE1Q96NA8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TSNARE1Q96NA8 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TSNARE1Q96NA8 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TSNARE1Q96NA8 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
TSNARE1Q96NA8 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TSNARE1Q96NA8 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TSNARE1Q96NA8 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TSNARE1Q96NA8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TSNARE1Q96NA8 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TSNARE1Q96NA8 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TSNARE1Q96NA8 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TSNARE1Q96NA8 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TSNARE1Q96NA8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TSNARE1Q96NA8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TSNARE1Q96NA8 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TSNARE1Q96NA8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TSNARE1Q96NA8 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TSNARE1Q96NA8 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TSNARE1Q96NA8 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TSNARE1Q96NA8 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TSNARE1Q96NA8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TSNARE1Q96NA8 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TSNARE1Q96NA8 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TSNARE1Q96NA8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TSNARE1Q96NA8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TSNARE1Q96NA8 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TSNARE1Q96NA8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TSNARE1Q96NA8 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TSNARE1Q96NA8 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TSNARE1Q96NA8 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TSNARE1Q96NA8 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TSNARE1Q96NA8 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TSNARE1Q96NA8 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TSNARE1Q96NA8 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TSNARE1Q96NA8 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TSNARE1Q96NA8 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TSNARE1Q96NA8 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TSNARE1Q96NA8 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TSNARE1Q96NA8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TSNARE1Q96NA8 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms