Protein–RNA interactions for Protein: Q96MR9

ZNF560, Zinc finger protein 560, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF560Q96MR9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF560Q96MR9 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF560Q96MR9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF560Q96MR9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF560Q96MR9 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF560Q96MR9 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF560Q96MR9 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF560Q96MR9 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF560Q96MR9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF560Q96MR9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF560Q96MR9 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF560Q96MR9 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF560Q96MR9 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF560Q96MR9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF560Q96MR9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF560Q96MR9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF560Q96MR9 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF560Q96MR9 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF560Q96MR9 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF560Q96MR9 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF560Q96MR9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF560Q96MR9 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF560Q96MR9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF560Q96MR9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF560Q96MR9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF560Q96MR9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF560Q96MR9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF560Q96MR9 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF560Q96MR9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF560Q96MR9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF560Q96MR9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF560Q96MR9 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF560Q96MR9 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF560Q96MR9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF560Q96MR9 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
ZNF560Q96MR9 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF560Q96MR9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF560Q96MR9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF560Q96MR9 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF560Q96MR9 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF560Q96MR9 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF560Q96MR9 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF560Q96MR9 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF560Q96MR9 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF560Q96MR9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF560Q96MR9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF560Q96MR9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF560Q96MR9 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF560Q96MR9 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF560Q96MR9 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF560Q96MR9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF560Q96MR9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF560Q96MR9 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF560Q96MR9 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF560Q96MR9 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF560Q96MR9 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF560Q96MR9 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF560Q96MR9 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF560Q96MR9 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF560Q96MR9 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF560Q96MR9 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF560Q96MR9 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF560Q96MR9 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF560Q96MR9 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF560Q96MR9 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF560Q96MR9 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF560Q96MR9 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF560Q96MR9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF560Q96MR9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF560Q96MR9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF560Q96MR9 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF560Q96MR9 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF560Q96MR9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF560Q96MR9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF560Q96MR9 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF560Q96MR9 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF560Q96MR9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF560Q96MR9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF560Q96MR9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF560Q96MR9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF560Q96MR9 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF560Q96MR9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF560Q96MR9 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF560Q96MR9 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF560Q96MR9 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF560Q96MR9 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF560Q96MR9 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF560Q96MR9 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF560Q96MR9 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF560Q96MR9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF560Q96MR9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF560Q96MR9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF560Q96MR9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF560Q96MR9 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF560Q96MR9 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF560Q96MR9 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF560Q96MR9 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF560Q96MR9 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF560Q96MR9 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF560Q96MR9 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms