Protein–RNA interactions for Protein: Q96M91

CFAP53, Cilia- and flagella-associated protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP53Q96M91 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CFAP53Q96M91 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CFAP53Q96M91 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
CFAP53Q96M91 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CFAP53Q96M91 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CFAP53Q96M91 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
CFAP53Q96M91 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CFAP53Q96M91 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CFAP53Q96M91 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CFAP53Q96M91 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CFAP53Q96M91 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CFAP53Q96M91 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CFAP53Q96M91 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CFAP53Q96M91 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CFAP53Q96M91 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CFAP53Q96M91 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CFAP53Q96M91 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CFAP53Q96M91 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CFAP53Q96M91 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CFAP53Q96M91 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CFAP53Q96M91 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CFAP53Q96M91 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CFAP53Q96M91 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CFAP53Q96M91 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CFAP53Q96M91 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CFAP53Q96M91 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CFAP53Q96M91 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CFAP53Q96M91 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CFAP53Q96M91 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CFAP53Q96M91 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CFAP53Q96M91 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CFAP53Q96M91 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CFAP53Q96M91 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CFAP53Q96M91 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CFAP53Q96M91 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CFAP53Q96M91 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CFAP53Q96M91 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CFAP53Q96M91 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CFAP53Q96M91 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CFAP53Q96M91 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CFAP53Q96M91 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CFAP53Q96M91 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CFAP53Q96M91 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
CFAP53Q96M91 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CFAP53Q96M91 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CFAP53Q96M91 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CFAP53Q96M91 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CFAP53Q96M91 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CFAP53Q96M91 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CFAP53Q96M91 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CFAP53Q96M91 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CFAP53Q96M91 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CFAP53Q96M91 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CFAP53Q96M91 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CFAP53Q96M91 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CFAP53Q96M91 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CFAP53Q96M91 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CFAP53Q96M91 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CFAP53Q96M91 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CFAP53Q96M91 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CFAP53Q96M91 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CFAP53Q96M91 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CFAP53Q96M91 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CFAP53Q96M91 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
CFAP53Q96M91 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CFAP53Q96M91 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CFAP53Q96M91 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CFAP53Q96M91 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CFAP53Q96M91 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CFAP53Q96M91 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CFAP53Q96M91 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.24
CFAP53Q96M91 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CFAP53Q96M91 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CFAP53Q96M91 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CFAP53Q96M91 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CFAP53Q96M91 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CFAP53Q96M91 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CFAP53Q96M91 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CFAP53Q96M91 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CFAP53Q96M91 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CFAP53Q96M91 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CFAP53Q96M91 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CFAP53Q96M91 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CFAP53Q96M91 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CFAP53Q96M91 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CFAP53Q96M91 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CFAP53Q96M91 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CFAP53Q96M91 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CFAP53Q96M91 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CFAP53Q96M91 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CFAP53Q96M91 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CFAP53Q96M91 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CFAP53Q96M91 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CFAP53Q96M91 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CFAP53Q96M91 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CFAP53Q96M91 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CFAP53Q96M91 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CFAP53Q96M91 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CFAP53Q96M91 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CFAP53Q96M91 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms