Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CNBD2Q96M20 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CNBD2Q96M20 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CNBD2Q96M20 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CNBD2Q96M20 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CNBD2Q96M20 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CNBD2Q96M20 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CNBD2Q96M20 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CNBD2Q96M20 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CNBD2Q96M20 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CNBD2Q96M20 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CNBD2Q96M20 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CNBD2Q96M20 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CNBD2Q96M20 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CNBD2Q96M20 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CNBD2Q96M20 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CNBD2Q96M20 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CNBD2Q96M20 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CNBD2Q96M20 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CNBD2Q96M20 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CNBD2Q96M20 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CNBD2Q96M20 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CNBD2Q96M20 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CNBD2Q96M20 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CNBD2Q96M20 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CNBD2Q96M20 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CNBD2Q96M20 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CNBD2Q96M20 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CNBD2Q96M20 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CNBD2Q96M20 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CNBD2Q96M20 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CNBD2Q96M20 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CNBD2Q96M20 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CNBD2Q96M20 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CNBD2Q96M20 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CNBD2Q96M20 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CNBD2Q96M20 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CNBD2Q96M20 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CNBD2Q96M20 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CNBD2Q96M20 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CNBD2Q96M20 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CNBD2Q96M20 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CNBD2Q96M20 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CNBD2Q96M20 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CNBD2Q96M20 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CNBD2Q96M20 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CNBD2Q96M20 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CNBD2Q96M20 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CNBD2Q96M20 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CNBD2Q96M20 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CNBD2Q96M20 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CNBD2Q96M20 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CNBD2Q96M20 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CNBD2Q96M20 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CNBD2Q96M20 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CNBD2Q96M20 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CNBD2Q96M20 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CNBD2Q96M20 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CNBD2Q96M20 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CNBD2Q96M20 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CNBD2Q96M20 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CNBD2Q96M20 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CNBD2Q96M20 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CNBD2Q96M20 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CNBD2Q96M20 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CNBD2Q96M20 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CNBD2Q96M20 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CNBD2Q96M20 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CNBD2Q96M20 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CNBD2Q96M20 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CNBD2Q96M20 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CNBD2Q96M20 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CNBD2Q96M20 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CNBD2Q96M20 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CNBD2Q96M20 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CNBD2Q96M20 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CNBD2Q96M20 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CNBD2Q96M20 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CNBD2Q96M20 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CNBD2Q96M20 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CNBD2Q96M20 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CNBD2Q96M20 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CNBD2Q96M20 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CNBD2Q96M20 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CNBD2Q96M20 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CNBD2Q96M20 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CNBD2Q96M20 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CNBD2Q96M20 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CNBD2Q96M20 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CNBD2Q96M20 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CNBD2Q96M20 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CNBD2Q96M20 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CNBD2Q96M20 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CNBD2Q96M20 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CNBD2Q96M20 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CNBD2Q96M20 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CNBD2Q96M20 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CNBD2Q96M20 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CNBD2Q96M20 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CNBD2Q96M20 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms