Protein–RNA interactions for Protein: Q96M19

LINC00477, Putative transmembrane protein encoded by LINC00477, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00477Q96M19 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00477Q96M19 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00477Q96M19 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00477Q96M19 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00477Q96M19 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00477Q96M19 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00477Q96M19 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00477Q96M19 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00477Q96M19 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00477Q96M19 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00477Q96M19 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00477Q96M19 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00477Q96M19 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00477Q96M19 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LINC00477Q96M19 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LINC00477Q96M19 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LINC00477Q96M19 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LINC00477Q96M19 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LINC00477Q96M19 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00477Q96M19 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00477Q96M19 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00477Q96M19 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00477Q96M19 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00477Q96M19 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00477Q96M19 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00477Q96M19 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00477Q96M19 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00477Q96M19 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00477Q96M19 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00477Q96M19 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00477Q96M19 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00477Q96M19 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00477Q96M19 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00477Q96M19 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00477Q96M19 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00477Q96M19 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00477Q96M19 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00477Q96M19 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00477Q96M19 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00477Q96M19 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00477Q96M19 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00477Q96M19 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00477Q96M19 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00477Q96M19 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00477Q96M19 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00477Q96M19 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00477Q96M19 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00477Q96M19 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00477Q96M19 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00477Q96M19 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00477Q96M19 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00477Q96M19 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00477Q96M19 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00477Q96M19 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00477Q96M19 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00477Q96M19 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00477Q96M19 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00477Q96M19 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00477Q96M19 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00477Q96M19 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00477Q96M19 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00477Q96M19 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00477Q96M19 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00477Q96M19 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00477Q96M19 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00477Q96M19 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00477Q96M19 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00477Q96M19 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00477Q96M19 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00477Q96M19 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00477Q96M19 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00477Q96M19 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00477Q96M19 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00477Q96M19 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00477Q96M19 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00477Q96M19 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00477Q96M19 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00477Q96M19 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00477Q96M19 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00477Q96M19 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00477Q96M19 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00477Q96M19 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00477Q96M19 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00477Q96M19 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00477Q96M19 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00477Q96M19 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00477Q96M19 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00477Q96M19 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00477Q96M19 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00477Q96M19 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00477Q96M19 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00477Q96M19 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00477Q96M19 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00477Q96M19 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00477Q96M19 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00477Q96M19 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00477Q96M19 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00477Q96M19 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00477Q96M19 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00477Q96M19 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms