Protein–RNA interactions for Protein: Q96JY6

PDLIM2, PDZ and LIM domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM2Q96JY6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDLIM2Q96JY6 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDLIM2Q96JY6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDLIM2Q96JY6 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDLIM2Q96JY6 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDLIM2Q96JY6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDLIM2Q96JY6 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDLIM2Q96JY6 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDLIM2Q96JY6 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDLIM2Q96JY6 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDLIM2Q96JY6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDLIM2Q96JY6 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDLIM2Q96JY6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDLIM2Q96JY6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDLIM2Q96JY6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDLIM2Q96JY6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PDLIM2Q96JY6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PDLIM2Q96JY6 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDLIM2Q96JY6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDLIM2Q96JY6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDLIM2Q96JY6 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PDLIM2Q96JY6 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PDLIM2Q96JY6 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PDLIM2Q96JY6 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PDLIM2Q96JY6 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PDLIM2Q96JY6 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDLIM2Q96JY6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDLIM2Q96JY6 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDLIM2Q96JY6 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDLIM2Q96JY6 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDLIM2Q96JY6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDLIM2Q96JY6 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDLIM2Q96JY6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDLIM2Q96JY6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDLIM2Q96JY6 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDLIM2Q96JY6 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDLIM2Q96JY6 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDLIM2Q96JY6 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDLIM2Q96JY6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDLIM2Q96JY6 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDLIM2Q96JY6 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDLIM2Q96JY6 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDLIM2Q96JY6 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDLIM2Q96JY6 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDLIM2Q96JY6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDLIM2Q96JY6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDLIM2Q96JY6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDLIM2Q96JY6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDLIM2Q96JY6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDLIM2Q96JY6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDLIM2Q96JY6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDLIM2Q96JY6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDLIM2Q96JY6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDLIM2Q96JY6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDLIM2Q96JY6 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDLIM2Q96JY6 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDLIM2Q96JY6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDLIM2Q96JY6 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDLIM2Q96JY6 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDLIM2Q96JY6 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDLIM2Q96JY6 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDLIM2Q96JY6 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDLIM2Q96JY6 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDLIM2Q96JY6 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDLIM2Q96JY6 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDLIM2Q96JY6 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDLIM2Q96JY6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDLIM2Q96JY6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDLIM2Q96JY6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDLIM2Q96JY6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDLIM2Q96JY6 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDLIM2Q96JY6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDLIM2Q96JY6 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDLIM2Q96JY6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDLIM2Q96JY6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDLIM2Q96JY6 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDLIM2Q96JY6 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDLIM2Q96JY6 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDLIM2Q96JY6 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDLIM2Q96JY6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDLIM2Q96JY6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDLIM2Q96JY6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDLIM2Q96JY6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDLIM2Q96JY6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDLIM2Q96JY6 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDLIM2Q96JY6 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDLIM2Q96JY6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDLIM2Q96JY6 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDLIM2Q96JY6 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDLIM2Q96JY6 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDLIM2Q96JY6 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDLIM2Q96JY6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PDLIM2Q96JY6 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDLIM2Q96JY6 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDLIM2Q96JY6 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDLIM2Q96JY6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDLIM2Q96JY6 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDLIM2Q96JY6 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDLIM2Q96JY6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDLIM2Q96JY6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms