Protein–RNA interactions for Protein: Q96JX3

SERAC1, Protein SERAC1, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERAC1Q96JX3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SERAC1Q96JX3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SERAC1Q96JX3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SERAC1Q96JX3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SERAC1Q96JX3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SERAC1Q96JX3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SERAC1Q96JX3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SERAC1Q96JX3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SERAC1Q96JX3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SERAC1Q96JX3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SERAC1Q96JX3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SERAC1Q96JX3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SERAC1Q96JX3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SERAC1Q96JX3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SERAC1Q96JX3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SERAC1Q96JX3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SERAC1Q96JX3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SERAC1Q96JX3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SERAC1Q96JX3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SERAC1Q96JX3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SERAC1Q96JX3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SERAC1Q96JX3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SERAC1Q96JX3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SERAC1Q96JX3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SERAC1Q96JX3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SERAC1Q96JX3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SERAC1Q96JX3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SERAC1Q96JX3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SERAC1Q96JX3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SERAC1Q96JX3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SERAC1Q96JX3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SERAC1Q96JX3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SERAC1Q96JX3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SERAC1Q96JX3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SERAC1Q96JX3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SERAC1Q96JX3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SERAC1Q96JX3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SERAC1Q96JX3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SERAC1Q96JX3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SERAC1Q96JX3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SERAC1Q96JX3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SERAC1Q96JX3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SERAC1Q96JX3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SERAC1Q96JX3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SERAC1Q96JX3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SERAC1Q96JX3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SERAC1Q96JX3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SERAC1Q96JX3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SERAC1Q96JX3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SERAC1Q96JX3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SERAC1Q96JX3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SERAC1Q96JX3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SERAC1Q96JX3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SERAC1Q96JX3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SERAC1Q96JX3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SERAC1Q96JX3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SERAC1Q96JX3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SERAC1Q96JX3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SERAC1Q96JX3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SERAC1Q96JX3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SERAC1Q96JX3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SERAC1Q96JX3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SERAC1Q96JX3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SERAC1Q96JX3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SERAC1Q96JX3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SERAC1Q96JX3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SERAC1Q96JX3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SERAC1Q96JX3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SERAC1Q96JX3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SERAC1Q96JX3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SERAC1Q96JX3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SERAC1Q96JX3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SERAC1Q96JX3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SERAC1Q96JX3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SERAC1Q96JX3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SERAC1Q96JX3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SERAC1Q96JX3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SERAC1Q96JX3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SERAC1Q96JX3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SERAC1Q96JX3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SERAC1Q96JX3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SERAC1Q96JX3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SERAC1Q96JX3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SERAC1Q96JX3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SERAC1Q96JX3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SERAC1Q96JX3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SERAC1Q96JX3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SERAC1Q96JX3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SERAC1Q96JX3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SERAC1Q96JX3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SERAC1Q96JX3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SERAC1Q96JX3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SERAC1Q96JX3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SERAC1Q96JX3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SERAC1Q96JX3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SERAC1Q96JX3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SERAC1Q96JX3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SERAC1Q96JX3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SERAC1Q96JX3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SERAC1Q96JX3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms