Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC136Q96JN2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC136Q96JN2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC136Q96JN2 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC136Q96JN2 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC136Q96JN2 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC136Q96JN2 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC136Q96JN2 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC136Q96JN2 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC136Q96JN2 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC136Q96JN2 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC136Q96JN2 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC136Q96JN2 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC136Q96JN2 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC136Q96JN2 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC136Q96JN2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC136Q96JN2 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC136Q96JN2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC136Q96JN2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC136Q96JN2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC136Q96JN2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC136Q96JN2 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC136Q96JN2 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC136Q96JN2 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC136Q96JN2 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC136Q96JN2 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC136Q96JN2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC136Q96JN2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC136Q96JN2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC136Q96JN2 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC136Q96JN2 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC136Q96JN2 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC136Q96JN2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC136Q96JN2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC136Q96JN2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC136Q96JN2 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC136Q96JN2 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC136Q96JN2 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC136Q96JN2 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC136Q96JN2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CCDC136Q96JN2 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC136Q96JN2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC136Q96JN2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC136Q96JN2 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC136Q96JN2 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC136Q96JN2 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC136Q96JN2 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC136Q96JN2 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC136Q96JN2 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC136Q96JN2 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC136Q96JN2 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC136Q96JN2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC136Q96JN2 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC136Q96JN2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC136Q96JN2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC136Q96JN2 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC136Q96JN2 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC136Q96JN2 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC136Q96JN2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC136Q96JN2 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC136Q96JN2 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC136Q96JN2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC136Q96JN2 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC136Q96JN2 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC136Q96JN2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC136Q96JN2 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC136Q96JN2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC136Q96JN2 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC136Q96JN2 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC136Q96JN2 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC136Q96JN2 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC136Q96JN2 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC136Q96JN2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC136Q96JN2 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC136Q96JN2 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC136Q96JN2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC136Q96JN2 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC136Q96JN2 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC136Q96JN2 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC136Q96JN2 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC136Q96JN2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC136Q96JN2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC136Q96JN2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC136Q96JN2 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC136Q96JN2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC136Q96JN2 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC136Q96JN2 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC136Q96JN2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC136Q96JN2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC136Q96JN2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC136Q96JN2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC136Q96JN2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC136Q96JN2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC136Q96JN2 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC136Q96JN2 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC136Q96JN2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC136Q96JN2 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC136Q96JN2 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC136Q96JN2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC136Q96JN2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms