Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZBED3Q96IU2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZBED3Q96IU2 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZBED3Q96IU2 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZBED3Q96IU2 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZBED3Q96IU2 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ZBED3Q96IU2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZBED3Q96IU2 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZBED3Q96IU2 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZBED3Q96IU2 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ZBED3Q96IU2 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZBED3Q96IU2 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZBED3Q96IU2 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZBED3Q96IU2 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZBED3Q96IU2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZBED3Q96IU2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZBED3Q96IU2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZBED3Q96IU2 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZBED3Q96IU2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZBED3Q96IU2 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZBED3Q96IU2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZBED3Q96IU2 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZBED3Q96IU2 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZBED3Q96IU2 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZBED3Q96IU2 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZBED3Q96IU2 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZBED3Q96IU2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ZBED3Q96IU2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ZBED3Q96IU2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ZBED3Q96IU2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ZBED3Q96IU2 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ZBED3Q96IU2 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ZBED3Q96IU2 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ZBED3Q96IU2 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ZBED3Q96IU2 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ZBED3Q96IU2 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
ZBED3Q96IU2 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ZBED3Q96IU2 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
ZBED3Q96IU2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ZBED3Q96IU2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ZBED3Q96IU2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ZBED3Q96IU2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZBED3Q96IU2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZBED3Q96IU2 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZBED3Q96IU2 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZBED3Q96IU2 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZBED3Q96IU2 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZBED3Q96IU2 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZBED3Q96IU2 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZBED3Q96IU2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZBED3Q96IU2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZBED3Q96IU2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZBED3Q96IU2 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZBED3Q96IU2 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZBED3Q96IU2 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZBED3Q96IU2 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZBED3Q96IU2 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZBED3Q96IU2 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
ZBED3Q96IU2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZBED3Q96IU2 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZBED3Q96IU2 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZBED3Q96IU2 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
ZBED3Q96IU2 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZBED3Q96IU2 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
ZBED3Q96IU2 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZBED3Q96IU2 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZBED3Q96IU2 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZBED3Q96IU2 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
ZBED3Q96IU2 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZBED3Q96IU2 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
ZBED3Q96IU2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZBED3Q96IU2 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZBED3Q96IU2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZBED3Q96IU2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZBED3Q96IU2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZBED3Q96IU2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZBED3Q96IU2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZBED3Q96IU2 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZBED3Q96IU2 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZBED3Q96IU2 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZBED3Q96IU2 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ZBED3Q96IU2 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZBED3Q96IU2 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ZBED3Q96IU2 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZBED3Q96IU2 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ZBED3Q96IU2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZBED3Q96IU2 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZBED3Q96IU2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ZBED3Q96IU2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ZBED3Q96IU2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
ZBED3Q96IU2 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ZBED3Q96IU2 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ZBED3Q96IU2 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
ZBED3Q96IU2 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ZBED3Q96IU2 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ZBED3Q96IU2 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ZBED3Q96IU2 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ZBED3Q96IU2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ZBED3Q96IU2 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ZBED3Q96IU2 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
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