Protein–RNA interactions for Protein: Q96I25

RBM17, Splicing factor 45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM17Q96I25 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RBM17Q96I25 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
RBM17Q96I25 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RBM17Q96I25 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
RBM17Q96I25 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RBM17Q96I25 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RBM17Q96I25 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RBM17Q96I25 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RBM17Q96I25 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RBM17Q96I25 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RBM17Q96I25 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RBM17Q96I25 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RBM17Q96I25 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RBM17Q96I25 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RBM17Q96I25 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RBM17Q96I25 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RBM17Q96I25 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RBM17Q96I25 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
RBM17Q96I25 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
RBM17Q96I25 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
RBM17Q96I25 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
RBM17Q96I25 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
RBM17Q96I25 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RBM17Q96I25 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RBM17Q96I25 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RBM17Q96I25 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
RBM17Q96I25 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
RBM17Q96I25 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RBM17Q96I25 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
RBM17Q96I25 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RBM17Q96I25 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RBM17Q96I25 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RBM17Q96I25 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RBM17Q96I25 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RBM17Q96I25 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RBM17Q96I25 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
RBM17Q96I25 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RBM17Q96I25 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RBM17Q96I25 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RBM17Q96I25 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RBM17Q96I25 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RBM17Q96I25 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RBM17Q96I25 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
RBM17Q96I25 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RBM17Q96I25 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RBM17Q96I25 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RBM17Q96I25 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RBM17Q96I25 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
RBM17Q96I25 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RBM17Q96I25 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RBM17Q96I25 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RBM17Q96I25 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RBM17Q96I25 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RBM17Q96I25 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RBM17Q96I25 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RBM17Q96I25 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RBM17Q96I25 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RBM17Q96I25 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RBM17Q96I25 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RBM17Q96I25 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RBM17Q96I25 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RBM17Q96I25 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RBM17Q96I25 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RBM17Q96I25 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
RBM17Q96I25 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RBM17Q96I25 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
RBM17Q96I25 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RBM17Q96I25 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RBM17Q96I25 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RBM17Q96I25 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RBM17Q96I25 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RBM17Q96I25 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RBM17Q96I25 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RBM17Q96I25 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RBM17Q96I25 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RBM17Q96I25 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RBM17Q96I25 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RBM17Q96I25 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
RBM17Q96I25 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RBM17Q96I25 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RBM17Q96I25 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
RBM17Q96I25 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RBM17Q96I25 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RBM17Q96I25 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RBM17Q96I25 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RBM17Q96I25 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RBM17Q96I25 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RBM17Q96I25 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RBM17Q96I25 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RBM17Q96I25 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RBM17Q96I25 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
RBM17Q96I25 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RBM17Q96I25 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
RBM17Q96I25 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RBM17Q96I25 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RBM17Q96I25 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RBM17Q96I25 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RBM17Q96I25 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RBM17Q96I25 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RBM17Q96I25 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
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