Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LTV1Q96GA3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
LTV1Q96GA3 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
LTV1Q96GA3 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
LTV1Q96GA3 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
LTV1Q96GA3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LTV1Q96GA3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LTV1Q96GA3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
LTV1Q96GA3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
LTV1Q96GA3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
LTV1Q96GA3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
LTV1Q96GA3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LTV1Q96GA3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LTV1Q96GA3 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LTV1Q96GA3 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
LTV1Q96GA3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LTV1Q96GA3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LTV1Q96GA3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
LTV1Q96GA3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
LTV1Q96GA3 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
LTV1Q96GA3 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
LTV1Q96GA3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
LTV1Q96GA3 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
LTV1Q96GA3 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
LTV1Q96GA3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LTV1Q96GA3 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
LTV1Q96GA3 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LTV1Q96GA3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
LTV1Q96GA3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LTV1Q96GA3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
LTV1Q96GA3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LTV1Q96GA3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LTV1Q96GA3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LTV1Q96GA3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LTV1Q96GA3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LTV1Q96GA3 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LTV1Q96GA3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LTV1Q96GA3 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LTV1Q96GA3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LTV1Q96GA3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LTV1Q96GA3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
LTV1Q96GA3 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
LTV1Q96GA3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
LTV1Q96GA3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LTV1Q96GA3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
LTV1Q96GA3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LTV1Q96GA3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LTV1Q96GA3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LTV1Q96GA3 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
LTV1Q96GA3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
LTV1Q96GA3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
LTV1Q96GA3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LTV1Q96GA3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LTV1Q96GA3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
LTV1Q96GA3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LTV1Q96GA3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
LTV1Q96GA3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LTV1Q96GA3 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
LTV1Q96GA3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LTV1Q96GA3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LTV1Q96GA3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
LTV1Q96GA3 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
LTV1Q96GA3 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
LTV1Q96GA3 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
LTV1Q96GA3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
LTV1Q96GA3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LTV1Q96GA3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LTV1Q96GA3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LTV1Q96GA3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LTV1Q96GA3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LTV1Q96GA3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LTV1Q96GA3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
LTV1Q96GA3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LTV1Q96GA3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LTV1Q96GA3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
LTV1Q96GA3 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
LTV1Q96GA3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LTV1Q96GA3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LTV1Q96GA3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LTV1Q96GA3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LTV1Q96GA3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LTV1Q96GA3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
LTV1Q96GA3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LTV1Q96GA3 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LTV1Q96GA3 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LTV1Q96GA3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LTV1Q96GA3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LTV1Q96GA3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LTV1Q96GA3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LTV1Q96GA3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
LTV1Q96GA3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
LTV1Q96GA3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LTV1Q96GA3 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LTV1Q96GA3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LTV1Q96GA3 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
LTV1Q96GA3 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
LTV1Q96GA3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LTV1Q96GA3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LTV1Q96GA3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
LTV1Q96GA3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms