Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP9

SLC10A4, Sodium/bile acid cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A4Q96EP9 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC10A4Q96EP9 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC10A4Q96EP9 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC10A4Q96EP9 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC10A4Q96EP9 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC10A4Q96EP9 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC10A4Q96EP9 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC10A4Q96EP9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC10A4Q96EP9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC10A4Q96EP9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC10A4Q96EP9 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC10A4Q96EP9 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC10A4Q96EP9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC10A4Q96EP9 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC10A4Q96EP9 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC10A4Q96EP9 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC10A4Q96EP9 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC10A4Q96EP9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC10A4Q96EP9 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC10A4Q96EP9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC10A4Q96EP9 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC10A4Q96EP9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC10A4Q96EP9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC10A4Q96EP9 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC10A4Q96EP9 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC10A4Q96EP9 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC10A4Q96EP9 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC10A4Q96EP9 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC10A4Q96EP9 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC10A4Q96EP9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC10A4Q96EP9 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC10A4Q96EP9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC10A4Q96EP9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC10A4Q96EP9 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC10A4Q96EP9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC10A4Q96EP9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC10A4Q96EP9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC10A4Q96EP9 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC10A4Q96EP9 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC10A4Q96EP9 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC10A4Q96EP9 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC10A4Q96EP9 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC10A4Q96EP9 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC10A4Q96EP9 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC10A4Q96EP9 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC10A4Q96EP9 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC10A4Q96EP9 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC10A4Q96EP9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC10A4Q96EP9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC10A4Q96EP9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC10A4Q96EP9 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC10A4Q96EP9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC10A4Q96EP9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC10A4Q96EP9 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC10A4Q96EP9 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC10A4Q96EP9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC10A4Q96EP9 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC10A4Q96EP9 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC10A4Q96EP9 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC10A4Q96EP9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC10A4Q96EP9 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC10A4Q96EP9 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC10A4Q96EP9 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC10A4Q96EP9 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC10A4Q96EP9 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC10A4Q96EP9 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC10A4Q96EP9 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC10A4Q96EP9 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC10A4Q96EP9 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC10A4Q96EP9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC10A4Q96EP9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC10A4Q96EP9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC10A4Q96EP9 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC10A4Q96EP9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC10A4Q96EP9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC10A4Q96EP9 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC10A4Q96EP9 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC10A4Q96EP9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC10A4Q96EP9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC10A4Q96EP9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC10A4Q96EP9 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC10A4Q96EP9 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC10A4Q96EP9 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC10A4Q96EP9 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC10A4Q96EP9 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC10A4Q96EP9 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC10A4Q96EP9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC10A4Q96EP9 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC10A4Q96EP9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC10A4Q96EP9 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SLC10A4Q96EP9 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SLC10A4Q96EP9 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC10A4Q96EP9 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC10A4Q96EP9 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC10A4Q96EP9 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC10A4Q96EP9 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC10A4Q96EP9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC10A4Q96EP9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC10A4Q96EP9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC10A4Q96EP9 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms