Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM1

PGBD4, PiggyBac transposable element-derived protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD4Q96DM1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PGBD4Q96DM1 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PGBD4Q96DM1 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PGBD4Q96DM1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PGBD4Q96DM1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PGBD4Q96DM1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PGBD4Q96DM1 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PGBD4Q96DM1 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PGBD4Q96DM1 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PGBD4Q96DM1 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PGBD4Q96DM1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PGBD4Q96DM1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PGBD4Q96DM1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PGBD4Q96DM1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PGBD4Q96DM1 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PGBD4Q96DM1 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PGBD4Q96DM1 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PGBD4Q96DM1 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PGBD4Q96DM1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PGBD4Q96DM1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PGBD4Q96DM1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PGBD4Q96DM1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PGBD4Q96DM1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PGBD4Q96DM1 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PGBD4Q96DM1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PGBD4Q96DM1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PGBD4Q96DM1 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PGBD4Q96DM1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PGBD4Q96DM1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PGBD4Q96DM1 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PGBD4Q96DM1 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PGBD4Q96DM1 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PGBD4Q96DM1 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PGBD4Q96DM1 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PGBD4Q96DM1 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PGBD4Q96DM1 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PGBD4Q96DM1 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PGBD4Q96DM1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PGBD4Q96DM1 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PGBD4Q96DM1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PGBD4Q96DM1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PGBD4Q96DM1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PGBD4Q96DM1 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PGBD4Q96DM1 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PGBD4Q96DM1 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PGBD4Q96DM1 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PGBD4Q96DM1 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PGBD4Q96DM1 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PGBD4Q96DM1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PGBD4Q96DM1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PGBD4Q96DM1 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PGBD4Q96DM1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PGBD4Q96DM1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PGBD4Q96DM1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PGBD4Q96DM1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PGBD4Q96DM1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PGBD4Q96DM1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PGBD4Q96DM1 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PGBD4Q96DM1 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PGBD4Q96DM1 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PGBD4Q96DM1 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PGBD4Q96DM1 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PGBD4Q96DM1 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PGBD4Q96DM1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PGBD4Q96DM1 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PGBD4Q96DM1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PGBD4Q96DM1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PGBD4Q96DM1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PGBD4Q96DM1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PGBD4Q96DM1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PGBD4Q96DM1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PGBD4Q96DM1 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PGBD4Q96DM1 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PGBD4Q96DM1 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PGBD4Q96DM1 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PGBD4Q96DM1 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PGBD4Q96DM1 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PGBD4Q96DM1 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PGBD4Q96DM1 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PGBD4Q96DM1 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PGBD4Q96DM1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PGBD4Q96DM1 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PGBD4Q96DM1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PGBD4Q96DM1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PGBD4Q96DM1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PGBD4Q96DM1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PGBD4Q96DM1 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PGBD4Q96DM1 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PGBD4Q96DM1 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PGBD4Q96DM1 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PGBD4Q96DM1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PGBD4Q96DM1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PGBD4Q96DM1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PGBD4Q96DM1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PGBD4Q96DM1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PGBD4Q96DM1 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PGBD4Q96DM1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PGBD4Q96DM1 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PGBD4Q96DM1 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PGBD4Q96DM1 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms