Protein–RNA interactions for Protein: Q96DE9

CXorf40B, Protein CXorf40B, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXorf40BQ96DE9 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CXorf40BQ96DE9 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CXorf40BQ96DE9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CXorf40BQ96DE9 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CXorf40BQ96DE9 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CXorf40BQ96DE9 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CXorf40BQ96DE9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CXorf40BQ96DE9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CXorf40BQ96DE9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CXorf40BQ96DE9 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CXorf40BQ96DE9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CXorf40BQ96DE9 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CXorf40BQ96DE9 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CXorf40BQ96DE9 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CXorf40BQ96DE9 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CXorf40BQ96DE9 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CXorf40BQ96DE9 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CXorf40BQ96DE9 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CXorf40BQ96DE9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CXorf40BQ96DE9 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CXorf40BQ96DE9 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CXorf40BQ96DE9 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CXorf40BQ96DE9 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CXorf40BQ96DE9 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CXorf40BQ96DE9 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CXorf40BQ96DE9 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CXorf40BQ96DE9 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
CXorf40BQ96DE9 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CXorf40BQ96DE9 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CXorf40BQ96DE9 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CXorf40BQ96DE9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CXorf40BQ96DE9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CXorf40BQ96DE9 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CXorf40BQ96DE9 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CXorf40BQ96DE9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CXorf40BQ96DE9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CXorf40BQ96DE9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CXorf40BQ96DE9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CXorf40BQ96DE9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CXorf40BQ96DE9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CXorf40BQ96DE9 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CXorf40BQ96DE9 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CXorf40BQ96DE9 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CXorf40BQ96DE9 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CXorf40BQ96DE9 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CXorf40BQ96DE9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CXorf40BQ96DE9 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CXorf40BQ96DE9 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CXorf40BQ96DE9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CXorf40BQ96DE9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CXorf40BQ96DE9 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CXorf40BQ96DE9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CXorf40BQ96DE9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CXorf40BQ96DE9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CXorf40BQ96DE9 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CXorf40BQ96DE9 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CXorf40BQ96DE9 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CXorf40BQ96DE9 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CXorf40BQ96DE9 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
CXorf40BQ96DE9 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
CXorf40BQ96DE9 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CXorf40BQ96DE9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CXorf40BQ96DE9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CXorf40BQ96DE9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CXorf40BQ96DE9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CXorf40BQ96DE9 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CXorf40BQ96DE9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CXorf40BQ96DE9 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CXorf40BQ96DE9 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CXorf40BQ96DE9 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CXorf40BQ96DE9 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CXorf40BQ96DE9 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CXorf40BQ96DE9 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CXorf40BQ96DE9 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CXorf40BQ96DE9 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CXorf40BQ96DE9 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CXorf40BQ96DE9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CXorf40BQ96DE9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CXorf40BQ96DE9 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CXorf40BQ96DE9 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CXorf40BQ96DE9 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CXorf40BQ96DE9 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CXorf40BQ96DE9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CXorf40BQ96DE9 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CXorf40BQ96DE9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CXorf40BQ96DE9 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CXorf40BQ96DE9 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CXorf40BQ96DE9 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CXorf40BQ96DE9 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CXorf40BQ96DE9 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CXorf40BQ96DE9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CXorf40BQ96DE9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CXorf40BQ96DE9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CXorf40BQ96DE9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CXorf40BQ96DE9 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CXorf40BQ96DE9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CXorf40BQ96DE9 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CXorf40BQ96DE9 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CXorf40BQ96DE9 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CXorf40BQ96DE9 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 159.4 ms