Protein–RNA interactions for Protein: Q96A61

TRIM52, Tripartite motif-containing protein 52, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM52Q96A61 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
TRIM52Q96A61 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
TRIM52Q96A61 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
TRIM52Q96A61 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
TRIM52Q96A61 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC32.29■■■□□ 2.76
TRIM52Q96A61 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
TRIM52Q96A61 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC32.29■■■□□ 2.76
TRIM52Q96A61 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
TRIM52Q96A61 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
TRIM52Q96A61 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
TRIM52Q96A61 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
TRIM52Q96A61 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
TRIM52Q96A61 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
TRIM52Q96A61 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
TRIM52Q96A61 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
TRIM52Q96A61 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC32.28■■■□□ 2.76
TRIM52Q96A61 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
TRIM52Q96A61 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
TRIM52Q96A61 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
TRIM52Q96A61 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
TRIM52Q96A61 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
TRIM52Q96A61 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
TRIM52Q96A61 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
TRIM52Q96A61 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
TRIM52Q96A61 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC32.27■■■□□ 2.76
TRIM52Q96A61 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
TRIM52Q96A61 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC32.27■■■□□ 2.76
TRIM52Q96A61 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
TRIM52Q96A61 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
TRIM52Q96A61 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
TRIM52Q96A61 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.76
TRIM52Q96A61 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
TRIM52Q96A61 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
TRIM52Q96A61 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC32.26■■■□□ 2.75
TRIM52Q96A61 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
TRIM52Q96A61 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
TRIM52Q96A61 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
TRIM52Q96A61 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
TRIM52Q96A61 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
TRIM52Q96A61 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
TRIM52Q96A61 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
TRIM52Q96A61 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
TRIM52Q96A61 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
TRIM52Q96A61 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
TRIM52Q96A61 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
TRIM52Q96A61 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
TRIM52Q96A61 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
TRIM52Q96A61 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
TRIM52Q96A61 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
TRIM52Q96A61 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
TRIM52Q96A61 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
TRIM52Q96A61 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
TRIM52Q96A61 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
TRIM52Q96A61 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
TRIM52Q96A61 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
TRIM52Q96A61 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
TRIM52Q96A61 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
TRIM52Q96A61 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
TRIM52Q96A61 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
TRIM52Q96A61 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
TRIM52Q96A61 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
TRIM52Q96A61 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
TRIM52Q96A61 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
TRIM52Q96A61 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
TRIM52Q96A61 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC32.23■■■□□ 2.75
TRIM52Q96A61 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
TRIM52Q96A61 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
TRIM52Q96A61 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
TRIM52Q96A61 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
TRIM52Q96A61 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
TRIM52Q96A61 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC32.22■■■□□ 2.75
TRIM52Q96A61 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
TRIM52Q96A61 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
TRIM52Q96A61 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
TRIM52Q96A61 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
TRIM52Q96A61 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
TRIM52Q96A61 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
TRIM52Q96A61 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
TRIM52Q96A61 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
TRIM52Q96A61 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
TRIM52Q96A61 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
TRIM52Q96A61 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
TRIM52Q96A61 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
TRIM52Q96A61 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
TRIM52Q96A61 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
TRIM52Q96A61 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
TRIM52Q96A61 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
TRIM52Q96A61 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
TRIM52Q96A61 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
TRIM52Q96A61 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC32.2■■■□□ 2.75
TRIM52Q96A61 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
TRIM52Q96A61 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
TRIM52Q96A61 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC32.2■■■□□ 2.75
TRIM52Q96A61 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
TRIM52Q96A61 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
TRIM52Q96A61 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
TRIM52Q96A61 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.74
TRIM52Q96A61 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC32.2■■■□□ 2.74
TRIM52Q96A61 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.74
TRIM52Q96A61 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms