Protein–RNA interactions for Protein: Q93038

TNFRSF25, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 25, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF25Q93038 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TNFRSF25Q93038 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNFRSF25Q93038 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNFRSF25Q93038 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNFRSF25Q93038 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TNFRSF25Q93038 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TNFRSF25Q93038 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TNFRSF25Q93038 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TNFRSF25Q93038 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNFRSF25Q93038 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNFRSF25Q93038 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNFRSF25Q93038 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TNFRSF25Q93038 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TNFRSF25Q93038 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNFRSF25Q93038 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNFRSF25Q93038 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNFRSF25Q93038 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNFRSF25Q93038 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNFRSF25Q93038 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNFRSF25Q93038 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNFRSF25Q93038 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNFRSF25Q93038 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNFRSF25Q93038 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNFRSF25Q93038 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNFRSF25Q93038 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNFRSF25Q93038 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNFRSF25Q93038 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNFRSF25Q93038 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TNFRSF25Q93038 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNFRSF25Q93038 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TNFRSF25Q93038 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNFRSF25Q93038 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNFRSF25Q93038 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNFRSF25Q93038 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNFRSF25Q93038 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TNFRSF25Q93038 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNFRSF25Q93038 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TNFRSF25Q93038 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNFRSF25Q93038 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNFRSF25Q93038 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNFRSF25Q93038 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNFRSF25Q93038 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNFRSF25Q93038 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNFRSF25Q93038 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNFRSF25Q93038 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNFRSF25Q93038 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNFRSF25Q93038 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNFRSF25Q93038 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TNFRSF25Q93038 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNFRSF25Q93038 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TNFRSF25Q93038 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNFRSF25Q93038 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNFRSF25Q93038 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNFRSF25Q93038 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNFRSF25Q93038 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNFRSF25Q93038 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNFRSF25Q93038 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNFRSF25Q93038 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNFRSF25Q93038 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNFRSF25Q93038 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNFRSF25Q93038 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNFRSF25Q93038 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNFRSF25Q93038 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNFRSF25Q93038 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNFRSF25Q93038 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNFRSF25Q93038 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNFRSF25Q93038 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNFRSF25Q93038 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNFRSF25Q93038 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNFRSF25Q93038 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNFRSF25Q93038 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNFRSF25Q93038 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNFRSF25Q93038 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TNFRSF25Q93038 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TNFRSF25Q93038 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNFRSF25Q93038 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNFRSF25Q93038 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNFRSF25Q93038 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNFRSF25Q93038 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNFRSF25Q93038 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNFRSF25Q93038 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNFRSF25Q93038 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNFRSF25Q93038 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TNFRSF25Q93038 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TNFRSF25Q93038 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNFRSF25Q93038 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TNFRSF25Q93038 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNFRSF25Q93038 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNFRSF25Q93038 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNFRSF25Q93038 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNFRSF25Q93038 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNFRSF25Q93038 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNFRSF25Q93038 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNFRSF25Q93038 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TNFRSF25Q93038 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNFRSF25Q93038 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNFRSF25Q93038 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNFRSF25Q93038 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNFRSF25Q93038 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNFRSF25Q93038 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms