Protein–RNA interactions for Protein: Q92994

BRF1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1Q92994 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BRF1Q92994 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BRF1Q92994 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BRF1Q92994 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BRF1Q92994 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BRF1Q92994 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BRF1Q92994 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BRF1Q92994 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BRF1Q92994 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BRF1Q92994 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BRF1Q92994 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BRF1Q92994 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BRF1Q92994 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BRF1Q92994 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BRF1Q92994 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BRF1Q92994 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BRF1Q92994 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BRF1Q92994 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BRF1Q92994 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BRF1Q92994 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BRF1Q92994 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BRF1Q92994 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BRF1Q92994 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BRF1Q92994 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BRF1Q92994 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BRF1Q92994 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
BRF1Q92994 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
BRF1Q92994 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
BRF1Q92994 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
BRF1Q92994 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
BRF1Q92994 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
BRF1Q92994 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
BRF1Q92994 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
BRF1Q92994 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
BRF1Q92994 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
BRF1Q92994 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
BRF1Q92994 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BRF1Q92994 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BRF1Q92994 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BRF1Q92994 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
BRF1Q92994 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
BRF1Q92994 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BRF1Q92994 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BRF1Q92994 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BRF1Q92994 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BRF1Q92994 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BRF1Q92994 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BRF1Q92994 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BRF1Q92994 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BRF1Q92994 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
BRF1Q92994 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BRF1Q92994 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BRF1Q92994 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRF1Q92994 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRF1Q92994 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRF1Q92994 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRF1Q92994 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRF1Q92994 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRF1Q92994 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
BRF1Q92994 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRF1Q92994 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRF1Q92994 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRF1Q92994 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRF1Q92994 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRF1Q92994 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRF1Q92994 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRF1Q92994 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BRF1Q92994 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BRF1Q92994 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BRF1Q92994 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BRF1Q92994 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BRF1Q92994 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BRF1Q92994 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BRF1Q92994 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BRF1Q92994 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BRF1Q92994 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BRF1Q92994 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BRF1Q92994 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRF1Q92994 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRF1Q92994 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRF1Q92994 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRF1Q92994 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRF1Q92994 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRF1Q92994 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRF1Q92994 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
BRF1Q92994 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BRF1Q92994 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
BRF1Q92994 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BRF1Q92994 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
BRF1Q92994 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
BRF1Q92994 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BRF1Q92994 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BRF1Q92994 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
BRF1Q92994 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BRF1Q92994 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BRF1Q92994 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BRF1Q92994 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BRF1Q92994 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BRF1Q92994 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BRF1Q92994 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms