Protein–RNA interactions for Protein: Q92854

SEMA4D, Semaphorin-4D, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4DQ92854 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEMA4DQ92854 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEMA4DQ92854 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEMA4DQ92854 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEMA4DQ92854 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEMA4DQ92854 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEMA4DQ92854 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SEMA4DQ92854 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEMA4DQ92854 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEMA4DQ92854 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEMA4DQ92854 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEMA4DQ92854 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMA4DQ92854 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMA4DQ92854 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMA4DQ92854 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMA4DQ92854 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMA4DQ92854 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMA4DQ92854 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMA4DQ92854 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMA4DQ92854 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMA4DQ92854 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMA4DQ92854 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMA4DQ92854 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMA4DQ92854 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMA4DQ92854 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMA4DQ92854 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMA4DQ92854 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMA4DQ92854 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMA4DQ92854 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEMA4DQ92854 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEMA4DQ92854 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEMA4DQ92854 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEMA4DQ92854 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEMA4DQ92854 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEMA4DQ92854 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEMA4DQ92854 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEMA4DQ92854 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEMA4DQ92854 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SEMA4DQ92854 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SEMA4DQ92854 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SEMA4DQ92854 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SEMA4DQ92854 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SEMA4DQ92854 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEMA4DQ92854 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEMA4DQ92854 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEMA4DQ92854 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SEMA4DQ92854 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEMA4DQ92854 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SEMA4DQ92854 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SEMA4DQ92854 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEMA4DQ92854 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEMA4DQ92854 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEMA4DQ92854 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEMA4DQ92854 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEMA4DQ92854 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA4DQ92854 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA4DQ92854 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA4DQ92854 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA4DQ92854 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA4DQ92854 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA4DQ92854 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA4DQ92854 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA4DQ92854 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA4DQ92854 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA4DQ92854 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA4DQ92854 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA4DQ92854 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA4DQ92854 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEMA4DQ92854 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEMA4DQ92854 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEMA4DQ92854 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SEMA4DQ92854 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SEMA4DQ92854 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SEMA4DQ92854 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEMA4DQ92854 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEMA4DQ92854 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEMA4DQ92854 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEMA4DQ92854 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEMA4DQ92854 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA4DQ92854 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA4DQ92854 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA4DQ92854 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA4DQ92854 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA4DQ92854 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA4DQ92854 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA4DQ92854 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA4DQ92854 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA4DQ92854 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA4DQ92854 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA4DQ92854 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA4DQ92854 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA4DQ92854 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA4DQ92854 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA4DQ92854 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA4DQ92854 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA4DQ92854 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA4DQ92854 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA4DQ92854 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA4DQ92854 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA4DQ92854 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms