Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

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Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RABGGTAQ92696 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RABGGTAQ92696 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RABGGTAQ92696 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RABGGTAQ92696 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RABGGTAQ92696 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RABGGTAQ92696 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RABGGTAQ92696 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RABGGTAQ92696 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RABGGTAQ92696 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RABGGTAQ92696 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RABGGTAQ92696 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RABGGTAQ92696 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RABGGTAQ92696 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RABGGTAQ92696 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RABGGTAQ92696 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RABGGTAQ92696 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RABGGTAQ92696 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RABGGTAQ92696 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RABGGTAQ92696 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RABGGTAQ92696 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RABGGTAQ92696 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RABGGTAQ92696 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RABGGTAQ92696 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RABGGTAQ92696 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RABGGTAQ92696 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RABGGTAQ92696 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RABGGTAQ92696 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RABGGTAQ92696 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RABGGTAQ92696 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RABGGTAQ92696 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RABGGTAQ92696 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RABGGTAQ92696 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RABGGTAQ92696 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RABGGTAQ92696 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RABGGTAQ92696 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RABGGTAQ92696 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RABGGTAQ92696 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RABGGTAQ92696 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RABGGTAQ92696 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RABGGTAQ92696 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RABGGTAQ92696 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RABGGTAQ92696 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RABGGTAQ92696 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RABGGTAQ92696 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RABGGTAQ92696 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RABGGTAQ92696 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RABGGTAQ92696 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RABGGTAQ92696 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RABGGTAQ92696 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RABGGTAQ92696 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RABGGTAQ92696 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RABGGTAQ92696 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RABGGTAQ92696 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RABGGTAQ92696 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RABGGTAQ92696 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RABGGTAQ92696 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RABGGTAQ92696 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RABGGTAQ92696 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RABGGTAQ92696 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RABGGTAQ92696 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RABGGTAQ92696 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RABGGTAQ92696 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RABGGTAQ92696 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RABGGTAQ92696 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RABGGTAQ92696 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RABGGTAQ92696 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RABGGTAQ92696 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RABGGTAQ92696 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RABGGTAQ92696 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RABGGTAQ92696 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RABGGTAQ92696 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RABGGTAQ92696 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RABGGTAQ92696 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RABGGTAQ92696 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RABGGTAQ92696 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RABGGTAQ92696 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RABGGTAQ92696 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RABGGTAQ92696 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RABGGTAQ92696 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RABGGTAQ92696 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RABGGTAQ92696 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RABGGTAQ92696 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RABGGTAQ92696 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RABGGTAQ92696 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RABGGTAQ92696 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RABGGTAQ92696 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RABGGTAQ92696 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RABGGTAQ92696 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RABGGTAQ92696 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RABGGTAQ92696 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RABGGTAQ92696 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RABGGTAQ92696 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RABGGTAQ92696 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RABGGTAQ92696 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RABGGTAQ92696 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RABGGTAQ92696 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RABGGTAQ92696 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RABGGTAQ92696 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RABGGTAQ92696 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
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