Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVP7

LMBR1, Limb region 1 protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1Q8WVP7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMBR1Q8WVP7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMBR1Q8WVP7 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMBR1Q8WVP7 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMBR1Q8WVP7 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMBR1Q8WVP7 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMBR1Q8WVP7 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
LMBR1Q8WVP7 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMBR1Q8WVP7 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMBR1Q8WVP7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMBR1Q8WVP7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMBR1Q8WVP7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMBR1Q8WVP7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMBR1Q8WVP7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMBR1Q8WVP7 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMBR1Q8WVP7 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMBR1Q8WVP7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMBR1Q8WVP7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMBR1Q8WVP7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMBR1Q8WVP7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMBR1Q8WVP7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMBR1Q8WVP7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMBR1Q8WVP7 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMBR1Q8WVP7 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMBR1Q8WVP7 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMBR1Q8WVP7 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMBR1Q8WVP7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMBR1Q8WVP7 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMBR1Q8WVP7 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMBR1Q8WVP7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMBR1Q8WVP7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMBR1Q8WVP7 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LMBR1Q8WVP7 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMBR1Q8WVP7 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMBR1Q8WVP7 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMBR1Q8WVP7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMBR1Q8WVP7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMBR1Q8WVP7 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMBR1Q8WVP7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMBR1Q8WVP7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMBR1Q8WVP7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LMBR1Q8WVP7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LMBR1Q8WVP7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LMBR1Q8WVP7 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LMBR1Q8WVP7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LMBR1Q8WVP7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LMBR1Q8WVP7 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LMBR1Q8WVP7 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LMBR1Q8WVP7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LMBR1Q8WVP7 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LMBR1Q8WVP7 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMBR1Q8WVP7 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMBR1Q8WVP7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMBR1Q8WVP7 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMBR1Q8WVP7 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMBR1Q8WVP7 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMBR1Q8WVP7 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMBR1Q8WVP7 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMBR1Q8WVP7 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMBR1Q8WVP7 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMBR1Q8WVP7 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
LMBR1Q8WVP7 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
LMBR1Q8WVP7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMBR1Q8WVP7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMBR1Q8WVP7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMBR1Q8WVP7 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMBR1Q8WVP7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMBR1Q8WVP7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMBR1Q8WVP7 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMBR1Q8WVP7 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMBR1Q8WVP7 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMBR1Q8WVP7 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMBR1Q8WVP7 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMBR1Q8WVP7 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMBR1Q8WVP7 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMBR1Q8WVP7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMBR1Q8WVP7 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMBR1Q8WVP7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMBR1Q8WVP7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMBR1Q8WVP7 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMBR1Q8WVP7 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMBR1Q8WVP7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMBR1Q8WVP7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMBR1Q8WVP7 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMBR1Q8WVP7 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMBR1Q8WVP7 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMBR1Q8WVP7 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
LMBR1Q8WVP7 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMBR1Q8WVP7 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
LMBR1Q8WVP7 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMBR1Q8WVP7 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMBR1Q8WVP7 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMBR1Q8WVP7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMBR1Q8WVP7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMBR1Q8WVP7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMBR1Q8WVP7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMBR1Q8WVP7 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMBR1Q8WVP7 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMBR1Q8WVP7 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMBR1Q8WVP7 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms