Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVJ9

TWIST2, Twist-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST2Q8WVJ9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TWIST2Q8WVJ9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TWIST2Q8WVJ9 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TWIST2Q8WVJ9 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TWIST2Q8WVJ9 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TWIST2Q8WVJ9 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TWIST2Q8WVJ9 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TWIST2Q8WVJ9 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TWIST2Q8WVJ9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TWIST2Q8WVJ9 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TWIST2Q8WVJ9 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TWIST2Q8WVJ9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TWIST2Q8WVJ9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TWIST2Q8WVJ9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TWIST2Q8WVJ9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TWIST2Q8WVJ9 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TWIST2Q8WVJ9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TWIST2Q8WVJ9 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TWIST2Q8WVJ9 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TWIST2Q8WVJ9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TWIST2Q8WVJ9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TWIST2Q8WVJ9 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TWIST2Q8WVJ9 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TWIST2Q8WVJ9 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TWIST2Q8WVJ9 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TWIST2Q8WVJ9 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TWIST2Q8WVJ9 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TWIST2Q8WVJ9 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TWIST2Q8WVJ9 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TWIST2Q8WVJ9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TWIST2Q8WVJ9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TWIST2Q8WVJ9 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TWIST2Q8WVJ9 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TWIST2Q8WVJ9 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TWIST2Q8WVJ9 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TWIST2Q8WVJ9 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TWIST2Q8WVJ9 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TWIST2Q8WVJ9 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TWIST2Q8WVJ9 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TWIST2Q8WVJ9 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TWIST2Q8WVJ9 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TWIST2Q8WVJ9 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TWIST2Q8WVJ9 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TWIST2Q8WVJ9 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TWIST2Q8WVJ9 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TWIST2Q8WVJ9 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TWIST2Q8WVJ9 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TWIST2Q8WVJ9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TWIST2Q8WVJ9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TWIST2Q8WVJ9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TWIST2Q8WVJ9 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TWIST2Q8WVJ9 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TWIST2Q8WVJ9 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TWIST2Q8WVJ9 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TWIST2Q8WVJ9 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TWIST2Q8WVJ9 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TWIST2Q8WVJ9 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TWIST2Q8WVJ9 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TWIST2Q8WVJ9 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TWIST2Q8WVJ9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TWIST2Q8WVJ9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TWIST2Q8WVJ9 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TWIST2Q8WVJ9 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TWIST2Q8WVJ9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TWIST2Q8WVJ9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TWIST2Q8WVJ9 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TWIST2Q8WVJ9 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TWIST2Q8WVJ9 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TWIST2Q8WVJ9 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TWIST2Q8WVJ9 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TWIST2Q8WVJ9 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TWIST2Q8WVJ9 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TWIST2Q8WVJ9 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TWIST2Q8WVJ9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TWIST2Q8WVJ9 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TWIST2Q8WVJ9 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TWIST2Q8WVJ9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TWIST2Q8WVJ9 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TWIST2Q8WVJ9 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TWIST2Q8WVJ9 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TWIST2Q8WVJ9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TWIST2Q8WVJ9 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TWIST2Q8WVJ9 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TWIST2Q8WVJ9 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TWIST2Q8WVJ9 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TWIST2Q8WVJ9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TWIST2Q8WVJ9 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TWIST2Q8WVJ9 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TWIST2Q8WVJ9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TWIST2Q8WVJ9 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TWIST2Q8WVJ9 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TWIST2Q8WVJ9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TWIST2Q8WVJ9 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TWIST2Q8WVJ9 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TWIST2Q8WVJ9 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TWIST2Q8WVJ9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TWIST2Q8WVJ9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TWIST2Q8WVJ9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TWIST2Q8WVJ9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TWIST2Q8WVJ9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms