Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUI4

HDAC7, Histone deacetylase 7, humanhuman

Predictions only

Length 952 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC7Q8WUI4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC7Q8WUI4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC7Q8WUI4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC7Q8WUI4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC7Q8WUI4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC7Q8WUI4 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC7Q8WUI4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC7Q8WUI4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC7Q8WUI4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC7Q8WUI4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC7Q8WUI4 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC7Q8WUI4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC7Q8WUI4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC7Q8WUI4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
HDAC7Q8WUI4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
HDAC7Q8WUI4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
HDAC7Q8WUI4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HDAC7Q8WUI4 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HDAC7Q8WUI4 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HDAC7Q8WUI4 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HDAC7Q8WUI4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HDAC7Q8WUI4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HDAC7Q8WUI4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
HDAC7Q8WUI4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HDAC7Q8WUI4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
HDAC7Q8WUI4 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HDAC7Q8WUI4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HDAC7Q8WUI4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDAC7Q8WUI4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDAC7Q8WUI4 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDAC7Q8WUI4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDAC7Q8WUI4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDAC7Q8WUI4 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDAC7Q8WUI4 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDAC7Q8WUI4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDAC7Q8WUI4 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDAC7Q8WUI4 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDAC7Q8WUI4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDAC7Q8WUI4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDAC7Q8WUI4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC7Q8WUI4 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC7Q8WUI4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC7Q8WUI4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC7Q8WUI4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC7Q8WUI4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC7Q8WUI4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC7Q8WUI4 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC7Q8WUI4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC7Q8WUI4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC7Q8WUI4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC7Q8WUI4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC7Q8WUI4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC7Q8WUI4 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC7Q8WUI4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC7Q8WUI4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC7Q8WUI4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC7Q8WUI4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDAC7Q8WUI4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDAC7Q8WUI4 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDAC7Q8WUI4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDAC7Q8WUI4 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDAC7Q8WUI4 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDAC7Q8WUI4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDAC7Q8WUI4 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HDAC7Q8WUI4 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDAC7Q8WUI4 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDAC7Q8WUI4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HDAC7Q8WUI4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDAC7Q8WUI4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDAC7Q8WUI4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDAC7Q8WUI4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDAC7Q8WUI4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDAC7Q8WUI4 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDAC7Q8WUI4 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDAC7Q8WUI4 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDAC7Q8WUI4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDAC7Q8WUI4 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
HDAC7Q8WUI4 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
HDAC7Q8WUI4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDAC7Q8WUI4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDAC7Q8WUI4 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDAC7Q8WUI4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDAC7Q8WUI4 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDAC7Q8WUI4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDAC7Q8WUI4 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDAC7Q8WUI4 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDAC7Q8WUI4 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDAC7Q8WUI4 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDAC7Q8WUI4 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDAC7Q8WUI4 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDAC7Q8WUI4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDAC7Q8WUI4 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDAC7Q8WUI4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDAC7Q8WUI4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDAC7Q8WUI4 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDAC7Q8WUI4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDAC7Q8WUI4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDAC7Q8WUI4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDAC7Q8WUI4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HDAC7Q8WUI4 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms