Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX29Q8TEQ0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX29Q8TEQ0 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX29Q8TEQ0 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX29Q8TEQ0 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX29Q8TEQ0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX29Q8TEQ0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX29Q8TEQ0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX29Q8TEQ0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX29Q8TEQ0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX29Q8TEQ0 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SNX29Q8TEQ0 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNX29Q8TEQ0 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNX29Q8TEQ0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNX29Q8TEQ0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNX29Q8TEQ0 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SNX29Q8TEQ0 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SNX29Q8TEQ0 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SNX29Q8TEQ0 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNX29Q8TEQ0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNX29Q8TEQ0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNX29Q8TEQ0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SNX29Q8TEQ0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNX29Q8TEQ0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX29Q8TEQ0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX29Q8TEQ0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX29Q8TEQ0 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX29Q8TEQ0 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX29Q8TEQ0 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX29Q8TEQ0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX29Q8TEQ0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX29Q8TEQ0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX29Q8TEQ0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX29Q8TEQ0 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX29Q8TEQ0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX29Q8TEQ0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX29Q8TEQ0 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX29Q8TEQ0 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX29Q8TEQ0 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX29Q8TEQ0 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX29Q8TEQ0 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX29Q8TEQ0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX29Q8TEQ0 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX29Q8TEQ0 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX29Q8TEQ0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX29Q8TEQ0 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX29Q8TEQ0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX29Q8TEQ0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX29Q8TEQ0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX29Q8TEQ0 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX29Q8TEQ0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX29Q8TEQ0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX29Q8TEQ0 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX29Q8TEQ0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX29Q8TEQ0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX29Q8TEQ0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX29Q8TEQ0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX29Q8TEQ0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX29Q8TEQ0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX29Q8TEQ0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX29Q8TEQ0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX29Q8TEQ0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX29Q8TEQ0 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX29Q8TEQ0 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX29Q8TEQ0 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX29Q8TEQ0 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX29Q8TEQ0 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX29Q8TEQ0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX29Q8TEQ0 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX29Q8TEQ0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX29Q8TEQ0 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX29Q8TEQ0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX29Q8TEQ0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX29Q8TEQ0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX29Q8TEQ0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX29Q8TEQ0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX29Q8TEQ0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX29Q8TEQ0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX29Q8TEQ0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX29Q8TEQ0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX29Q8TEQ0 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SNX29Q8TEQ0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SNX29Q8TEQ0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SNX29Q8TEQ0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SNX29Q8TEQ0 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SNX29Q8TEQ0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
SNX29Q8TEQ0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SNX29Q8TEQ0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SNX29Q8TEQ0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNX29Q8TEQ0 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNX29Q8TEQ0 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNX29Q8TEQ0 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNX29Q8TEQ0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNX29Q8TEQ0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNX29Q8TEQ0 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNX29Q8TEQ0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNX29Q8TEQ0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNX29Q8TEQ0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX29Q8TEQ0 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX29Q8TEQ0 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms