Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC56

FAM71B, Protein FAM71B, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71BQ8TC56 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM71BQ8TC56 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM71BQ8TC56 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM71BQ8TC56 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM71BQ8TC56 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM71BQ8TC56 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM71BQ8TC56 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM71BQ8TC56 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM71BQ8TC56 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM71BQ8TC56 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM71BQ8TC56 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM71BQ8TC56 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM71BQ8TC56 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM71BQ8TC56 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM71BQ8TC56 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM71BQ8TC56 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM71BQ8TC56 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM71BQ8TC56 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM71BQ8TC56 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM71BQ8TC56 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM71BQ8TC56 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM71BQ8TC56 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM71BQ8TC56 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM71BQ8TC56 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM71BQ8TC56 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM71BQ8TC56 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM71BQ8TC56 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM71BQ8TC56 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM71BQ8TC56 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM71BQ8TC56 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM71BQ8TC56 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM71BQ8TC56 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM71BQ8TC56 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM71BQ8TC56 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM71BQ8TC56 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM71BQ8TC56 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM71BQ8TC56 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM71BQ8TC56 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM71BQ8TC56 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM71BQ8TC56 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM71BQ8TC56 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM71BQ8TC56 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM71BQ8TC56 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM71BQ8TC56 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM71BQ8TC56 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM71BQ8TC56 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM71BQ8TC56 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM71BQ8TC56 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM71BQ8TC56 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM71BQ8TC56 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM71BQ8TC56 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM71BQ8TC56 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM71BQ8TC56 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM71BQ8TC56 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM71BQ8TC56 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FAM71BQ8TC56 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
FAM71BQ8TC56 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM71BQ8TC56 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM71BQ8TC56 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM71BQ8TC56 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM71BQ8TC56 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM71BQ8TC56 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM71BQ8TC56 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM71BQ8TC56 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM71BQ8TC56 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM71BQ8TC56 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM71BQ8TC56 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM71BQ8TC56 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM71BQ8TC56 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM71BQ8TC56 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM71BQ8TC56 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM71BQ8TC56 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM71BQ8TC56 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM71BQ8TC56 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM71BQ8TC56 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM71BQ8TC56 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM71BQ8TC56 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM71BQ8TC56 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM71BQ8TC56 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM71BQ8TC56 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM71BQ8TC56 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM71BQ8TC56 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM71BQ8TC56 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM71BQ8TC56 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM71BQ8TC56 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM71BQ8TC56 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM71BQ8TC56 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM71BQ8TC56 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM71BQ8TC56 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM71BQ8TC56 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM71BQ8TC56 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM71BQ8TC56 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM71BQ8TC56 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM71BQ8TC56 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM71BQ8TC56 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM71BQ8TC56 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM71BQ8TC56 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM71BQ8TC56 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM71BQ8TC56 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM71BQ8TC56 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms