Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBZ0

CCDC110, Coiled-coil domain-containing protein 110, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC110Q8TBZ0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC110Q8TBZ0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC110Q8TBZ0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC110Q8TBZ0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC110Q8TBZ0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC110Q8TBZ0 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC110Q8TBZ0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC110Q8TBZ0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC110Q8TBZ0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC110Q8TBZ0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC110Q8TBZ0 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC110Q8TBZ0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC110Q8TBZ0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC110Q8TBZ0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC110Q8TBZ0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC110Q8TBZ0 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC110Q8TBZ0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC110Q8TBZ0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC110Q8TBZ0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC110Q8TBZ0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC110Q8TBZ0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC110Q8TBZ0 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC110Q8TBZ0 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC110Q8TBZ0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC110Q8TBZ0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC110Q8TBZ0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC110Q8TBZ0 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC110Q8TBZ0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC110Q8TBZ0 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC110Q8TBZ0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC110Q8TBZ0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC110Q8TBZ0 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC110Q8TBZ0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC110Q8TBZ0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC110Q8TBZ0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC110Q8TBZ0 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC110Q8TBZ0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC110Q8TBZ0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC110Q8TBZ0 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC110Q8TBZ0 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC110Q8TBZ0 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC110Q8TBZ0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC110Q8TBZ0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC110Q8TBZ0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC110Q8TBZ0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC110Q8TBZ0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC110Q8TBZ0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC110Q8TBZ0 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC110Q8TBZ0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC110Q8TBZ0 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC110Q8TBZ0 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC110Q8TBZ0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC110Q8TBZ0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC110Q8TBZ0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC110Q8TBZ0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC110Q8TBZ0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC110Q8TBZ0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC110Q8TBZ0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC110Q8TBZ0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC110Q8TBZ0 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC110Q8TBZ0 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC110Q8TBZ0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC110Q8TBZ0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC110Q8TBZ0 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC110Q8TBZ0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC110Q8TBZ0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC110Q8TBZ0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC110Q8TBZ0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC110Q8TBZ0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC110Q8TBZ0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC110Q8TBZ0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC110Q8TBZ0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC110Q8TBZ0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC110Q8TBZ0 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC110Q8TBZ0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC110Q8TBZ0 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC110Q8TBZ0 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC110Q8TBZ0 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC110Q8TBZ0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC110Q8TBZ0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC110Q8TBZ0 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC110Q8TBZ0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC110Q8TBZ0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC110Q8TBZ0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC110Q8TBZ0 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC110Q8TBZ0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC110Q8TBZ0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC110Q8TBZ0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC110Q8TBZ0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC110Q8TBZ0 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC110Q8TBZ0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC110Q8TBZ0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC110Q8TBZ0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC110Q8TBZ0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC110Q8TBZ0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC110Q8TBZ0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC110Q8TBZ0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC110Q8TBZ0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC110Q8TBZ0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC110Q8TBZ0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms