Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH1

TTLL11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, humanhuman

Predictions only

Length 800 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL11Q8NHH1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
TTLL11Q8NHH1 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TTLL11Q8NHH1 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TTLL11Q8NHH1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TTLL11Q8NHH1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TTLL11Q8NHH1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TTLL11Q8NHH1 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TTLL11Q8NHH1 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TTLL11Q8NHH1 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TTLL11Q8NHH1 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TTLL11Q8NHH1 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TTLL11Q8NHH1 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TTLL11Q8NHH1 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TTLL11Q8NHH1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TTLL11Q8NHH1 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TTLL11Q8NHH1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TTLL11Q8NHH1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TTLL11Q8NHH1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TTLL11Q8NHH1 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TTLL11Q8NHH1 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TTLL11Q8NHH1 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TTLL11Q8NHH1 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TTLL11Q8NHH1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TTLL11Q8NHH1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TTLL11Q8NHH1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TTLL11Q8NHH1 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TTLL11Q8NHH1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TTLL11Q8NHH1 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TTLL11Q8NHH1 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TTLL11Q8NHH1 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TTLL11Q8NHH1 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TTLL11Q8NHH1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TTLL11Q8NHH1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.92
TTLL11Q8NHH1 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
TTLL11Q8NHH1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
TTLL11Q8NHH1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
TTLL11Q8NHH1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TTLL11Q8NHH1 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TTLL11Q8NHH1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TTLL11Q8NHH1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TTLL11Q8NHH1 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TTLL11Q8NHH1 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TTLL11Q8NHH1 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TTLL11Q8NHH1 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TTLL11Q8NHH1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TTLL11Q8NHH1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TTLL11Q8NHH1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TTLL11Q8NHH1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TTLL11Q8NHH1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TTLL11Q8NHH1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TTLL11Q8NHH1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TTLL11Q8NHH1 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TTLL11Q8NHH1 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
TTLL11Q8NHH1 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
TTLL11Q8NHH1 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC27■■□□□ 1.91
TTLL11Q8NHH1 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC27■■□□□ 1.91
TTLL11Q8NHH1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TTLL11Q8NHH1 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TTLL11Q8NHH1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TTLL11Q8NHH1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TTLL11Q8NHH1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TTLL11Q8NHH1 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TTLL11Q8NHH1 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TTLL11Q8NHH1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
TTLL11Q8NHH1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TTLL11Q8NHH1 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TTLL11Q8NHH1 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TTLL11Q8NHH1 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TTLL11Q8NHH1 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TTLL11Q8NHH1 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TTLL11Q8NHH1 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TTLL11Q8NHH1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TTLL11Q8NHH1 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TTLL11Q8NHH1 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TTLL11Q8NHH1 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TTLL11Q8NHH1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TTLL11Q8NHH1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TTLL11Q8NHH1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TTLL11Q8NHH1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TTLL11Q8NHH1 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TTLL11Q8NHH1 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TTLL11Q8NHH1 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TTLL11Q8NHH1 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TTLL11Q8NHH1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TTLL11Q8NHH1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TTLL11Q8NHH1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TTLL11Q8NHH1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TTLL11Q8NHH1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
TTLL11Q8NHH1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TTLL11Q8NHH1 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TTLL11Q8NHH1 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
TTLL11Q8NHH1 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TTLL11Q8NHH1 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TTLL11Q8NHH1 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
TTLL11Q8NHH1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TTLL11Q8NHH1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TTLL11Q8NHH1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TTLL11Q8NHH1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TTLL11Q8NHH1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TTLL11Q8NHH1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms