Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEMA6DQ8NFY4 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEMA6DQ8NFY4 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEMA6DQ8NFY4 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEMA6DQ8NFY4 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SEMA6DQ8NFY4 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEMA6DQ8NFY4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEMA6DQ8NFY4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SEMA6DQ8NFY4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEMA6DQ8NFY4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEMA6DQ8NFY4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEMA6DQ8NFY4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEMA6DQ8NFY4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA6DQ8NFY4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA6DQ8NFY4 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA6DQ8NFY4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA6DQ8NFY4 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA6DQ8NFY4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA6DQ8NFY4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA6DQ8NFY4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA6DQ8NFY4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA6DQ8NFY4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA6DQ8NFY4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA6DQ8NFY4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA6DQ8NFY4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA6DQ8NFY4 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA6DQ8NFY4 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA6DQ8NFY4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA6DQ8NFY4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA6DQ8NFY4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA6DQ8NFY4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA6DQ8NFY4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA6DQ8NFY4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA6DQ8NFY4 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA6DQ8NFY4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA6DQ8NFY4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA6DQ8NFY4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA6DQ8NFY4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA6DQ8NFY4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA6DQ8NFY4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA6DQ8NFY4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA6DQ8NFY4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA6DQ8NFY4 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA6DQ8NFY4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA6DQ8NFY4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA6DQ8NFY4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA6DQ8NFY4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA6DQ8NFY4 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA6DQ8NFY4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEMA6DQ8NFY4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEMA6DQ8NFY4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEMA6DQ8NFY4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEMA6DQ8NFY4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEMA6DQ8NFY4 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEMA6DQ8NFY4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEMA6DQ8NFY4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEMA6DQ8NFY4 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEMA6DQ8NFY4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEMA6DQ8NFY4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEMA6DQ8NFY4 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEMA6DQ8NFY4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEMA6DQ8NFY4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEMA6DQ8NFY4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA6DQ8NFY4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA6DQ8NFY4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA6DQ8NFY4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA6DQ8NFY4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA6DQ8NFY4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA6DQ8NFY4 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA6DQ8NFY4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA6DQ8NFY4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA6DQ8NFY4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA6DQ8NFY4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA6DQ8NFY4 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA6DQ8NFY4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA6DQ8NFY4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA6DQ8NFY4 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA6DQ8NFY4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA6DQ8NFY4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA6DQ8NFY4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA6DQ8NFY4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA6DQ8NFY4 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA6DQ8NFY4 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA6DQ8NFY4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA6DQ8NFY4 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA6DQ8NFY4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA6DQ8NFY4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA6DQ8NFY4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA6DQ8NFY4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA6DQ8NFY4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA6DQ8NFY4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA6DQ8NFY4 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SEMA6DQ8NFY4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SEMA6DQ8NFY4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SEMA6DQ8NFY4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SEMA6DQ8NFY4 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SEMA6DQ8NFY4 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SEMA6DQ8NFY4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SEMA6DQ8NFY4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SEMA6DQ8NFY4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms