Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEY3

SPATA4, Spermatogenesis-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA4Q8NEY3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPATA4Q8NEY3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPATA4Q8NEY3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPATA4Q8NEY3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPATA4Q8NEY3 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPATA4Q8NEY3 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPATA4Q8NEY3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPATA4Q8NEY3 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPATA4Q8NEY3 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPATA4Q8NEY3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPATA4Q8NEY3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPATA4Q8NEY3 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPATA4Q8NEY3 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPATA4Q8NEY3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPATA4Q8NEY3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPATA4Q8NEY3 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPATA4Q8NEY3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPATA4Q8NEY3 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPATA4Q8NEY3 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPATA4Q8NEY3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPATA4Q8NEY3 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPATA4Q8NEY3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPATA4Q8NEY3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPATA4Q8NEY3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPATA4Q8NEY3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPATA4Q8NEY3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPATA4Q8NEY3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPATA4Q8NEY3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPATA4Q8NEY3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPATA4Q8NEY3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPATA4Q8NEY3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPATA4Q8NEY3 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SPATA4Q8NEY3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPATA4Q8NEY3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPATA4Q8NEY3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPATA4Q8NEY3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPATA4Q8NEY3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPATA4Q8NEY3 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPATA4Q8NEY3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPATA4Q8NEY3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SPATA4Q8NEY3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPATA4Q8NEY3 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPATA4Q8NEY3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPATA4Q8NEY3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPATA4Q8NEY3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPATA4Q8NEY3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPATA4Q8NEY3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPATA4Q8NEY3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPATA4Q8NEY3 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPATA4Q8NEY3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPATA4Q8NEY3 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPATA4Q8NEY3 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPATA4Q8NEY3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPATA4Q8NEY3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPATA4Q8NEY3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPATA4Q8NEY3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPATA4Q8NEY3 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SPATA4Q8NEY3 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SPATA4Q8NEY3 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPATA4Q8NEY3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPATA4Q8NEY3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPATA4Q8NEY3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPATA4Q8NEY3 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPATA4Q8NEY3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPATA4Q8NEY3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPATA4Q8NEY3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPATA4Q8NEY3 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPATA4Q8NEY3 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPATA4Q8NEY3 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPATA4Q8NEY3 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPATA4Q8NEY3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPATA4Q8NEY3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPATA4Q8NEY3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SPATA4Q8NEY3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SPATA4Q8NEY3 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPATA4Q8NEY3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPATA4Q8NEY3 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPATA4Q8NEY3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPATA4Q8NEY3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPATA4Q8NEY3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPATA4Q8NEY3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPATA4Q8NEY3 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPATA4Q8NEY3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPATA4Q8NEY3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPATA4Q8NEY3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPATA4Q8NEY3 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPATA4Q8NEY3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPATA4Q8NEY3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPATA4Q8NEY3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPATA4Q8NEY3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPATA4Q8NEY3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPATA4Q8NEY3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SPATA4Q8NEY3 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPATA4Q8NEY3 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPATA4Q8NEY3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPATA4Q8NEY3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPATA4Q8NEY3 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPATA4Q8NEY3 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPATA4Q8NEY3 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPATA4Q8NEY3 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms