Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CARMIL3Q8ND23 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CARMIL3Q8ND23 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CARMIL3Q8ND23 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CARMIL3Q8ND23 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CARMIL3Q8ND23 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CARMIL3Q8ND23 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CARMIL3Q8ND23 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CARMIL3Q8ND23 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CARMIL3Q8ND23 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CARMIL3Q8ND23 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CARMIL3Q8ND23 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CARMIL3Q8ND23 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CARMIL3Q8ND23 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CARMIL3Q8ND23 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CARMIL3Q8ND23 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CARMIL3Q8ND23 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CARMIL3Q8ND23 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CARMIL3Q8ND23 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CARMIL3Q8ND23 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CARMIL3Q8ND23 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CARMIL3Q8ND23 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CARMIL3Q8ND23 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CARMIL3Q8ND23 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CARMIL3Q8ND23 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CARMIL3Q8ND23 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CARMIL3Q8ND23 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CARMIL3Q8ND23 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CARMIL3Q8ND23 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CARMIL3Q8ND23 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CARMIL3Q8ND23 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CARMIL3Q8ND23 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CARMIL3Q8ND23 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CARMIL3Q8ND23 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CARMIL3Q8ND23 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CARMIL3Q8ND23 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CARMIL3Q8ND23 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CARMIL3Q8ND23 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CARMIL3Q8ND23 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CARMIL3Q8ND23 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CARMIL3Q8ND23 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CARMIL3Q8ND23 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CARMIL3Q8ND23 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CARMIL3Q8ND23 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CARMIL3Q8ND23 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CARMIL3Q8ND23 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CARMIL3Q8ND23 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CARMIL3Q8ND23 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CARMIL3Q8ND23 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CARMIL3Q8ND23 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CARMIL3Q8ND23 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CARMIL3Q8ND23 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CARMIL3Q8ND23 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CARMIL3Q8ND23 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CARMIL3Q8ND23 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CARMIL3Q8ND23 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CARMIL3Q8ND23 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CARMIL3Q8ND23 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CARMIL3Q8ND23 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CARMIL3Q8ND23 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CARMIL3Q8ND23 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CARMIL3Q8ND23 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CARMIL3Q8ND23 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CARMIL3Q8ND23 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CARMIL3Q8ND23 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CARMIL3Q8ND23 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CARMIL3Q8ND23 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CARMIL3Q8ND23 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CARMIL3Q8ND23 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CARMIL3Q8ND23 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CARMIL3Q8ND23 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CARMIL3Q8ND23 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
CARMIL3Q8ND23 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CARMIL3Q8ND23 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CARMIL3Q8ND23 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
CARMIL3Q8ND23 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CARMIL3Q8ND23 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CARMIL3Q8ND23 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CARMIL3Q8ND23 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CARMIL3Q8ND23 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CARMIL3Q8ND23 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CARMIL3Q8ND23 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CARMIL3Q8ND23 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CARMIL3Q8ND23 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CARMIL3Q8ND23 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CARMIL3Q8ND23 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CARMIL3Q8ND23 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CARMIL3Q8ND23 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CARMIL3Q8ND23 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CARMIL3Q8ND23 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CARMIL3Q8ND23 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CARMIL3Q8ND23 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CARMIL3Q8ND23 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CARMIL3Q8ND23 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CARMIL3Q8ND23 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CARMIL3Q8ND23 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CARMIL3Q8ND23 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CARMIL3Q8ND23 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CARMIL3Q8ND23 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CARMIL3Q8ND23 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms