Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCS7

SLC44A5, Choline transporter-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC44A5Q8NCS7 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC44A5Q8NCS7 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC44A5Q8NCS7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC44A5Q8NCS7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC44A5Q8NCS7 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC44A5Q8NCS7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC44A5Q8NCS7 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC44A5Q8NCS7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC44A5Q8NCS7 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC44A5Q8NCS7 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC44A5Q8NCS7 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC44A5Q8NCS7 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC44A5Q8NCS7 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC44A5Q8NCS7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC44A5Q8NCS7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC44A5Q8NCS7 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC44A5Q8NCS7 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC44A5Q8NCS7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC44A5Q8NCS7 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC44A5Q8NCS7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC44A5Q8NCS7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC44A5Q8NCS7 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC44A5Q8NCS7 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC44A5Q8NCS7 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC44A5Q8NCS7 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC44A5Q8NCS7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC44A5Q8NCS7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC44A5Q8NCS7 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC44A5Q8NCS7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC44A5Q8NCS7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC44A5Q8NCS7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC44A5Q8NCS7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SLC44A5Q8NCS7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SLC44A5Q8NCS7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SLC44A5Q8NCS7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC44A5Q8NCS7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC44A5Q8NCS7 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC44A5Q8NCS7 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC44A5Q8NCS7 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC44A5Q8NCS7 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC44A5Q8NCS7 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC44A5Q8NCS7 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC44A5Q8NCS7 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC44A5Q8NCS7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC44A5Q8NCS7 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC44A5Q8NCS7 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC44A5Q8NCS7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC44A5Q8NCS7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC44A5Q8NCS7 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC44A5Q8NCS7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC44A5Q8NCS7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC44A5Q8NCS7 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC44A5Q8NCS7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC44A5Q8NCS7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC44A5Q8NCS7 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC44A5Q8NCS7 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC44A5Q8NCS7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC44A5Q8NCS7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC44A5Q8NCS7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC44A5Q8NCS7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC44A5Q8NCS7 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC44A5Q8NCS7 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC44A5Q8NCS7 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC44A5Q8NCS7 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC44A5Q8NCS7 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC44A5Q8NCS7 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC44A5Q8NCS7 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC44A5Q8NCS7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC44A5Q8NCS7 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC44A5Q8NCS7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC44A5Q8NCS7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC44A5Q8NCS7 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC44A5Q8NCS7 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC44A5Q8NCS7 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC44A5Q8NCS7 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC44A5Q8NCS7 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC44A5Q8NCS7 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC44A5Q8NCS7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC44A5Q8NCS7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC44A5Q8NCS7 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC44A5Q8NCS7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC44A5Q8NCS7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC44A5Q8NCS7 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC44A5Q8NCS7 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC44A5Q8NCS7 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC44A5Q8NCS7 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC44A5Q8NCS7 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC44A5Q8NCS7 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC44A5Q8NCS7 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC44A5Q8NCS7 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC44A5Q8NCS7 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC44A5Q8NCS7 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC44A5Q8NCS7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC44A5Q8NCS7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC44A5Q8NCS7 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC44A5Q8NCS7 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC44A5Q8NCS7 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC44A5Q8NCS7 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC44A5Q8NCS7 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC44A5Q8NCS7 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms