Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZIC4Q8N9L1 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZIC4Q8N9L1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZIC4Q8N9L1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZIC4Q8N9L1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZIC4Q8N9L1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZIC4Q8N9L1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZIC4Q8N9L1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZIC4Q8N9L1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ZIC4Q8N9L1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZIC4Q8N9L1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZIC4Q8N9L1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZIC4Q8N9L1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZIC4Q8N9L1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZIC4Q8N9L1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZIC4Q8N9L1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZIC4Q8N9L1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZIC4Q8N9L1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZIC4Q8N9L1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZIC4Q8N9L1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZIC4Q8N9L1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZIC4Q8N9L1 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZIC4Q8N9L1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZIC4Q8N9L1 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZIC4Q8N9L1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZIC4Q8N9L1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZIC4Q8N9L1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZIC4Q8N9L1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZIC4Q8N9L1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZIC4Q8N9L1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZIC4Q8N9L1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZIC4Q8N9L1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZIC4Q8N9L1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZIC4Q8N9L1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ZIC4Q8N9L1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZIC4Q8N9L1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZIC4Q8N9L1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZIC4Q8N9L1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZIC4Q8N9L1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZIC4Q8N9L1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZIC4Q8N9L1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZIC4Q8N9L1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZIC4Q8N9L1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZIC4Q8N9L1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZIC4Q8N9L1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZIC4Q8N9L1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZIC4Q8N9L1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZIC4Q8N9L1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZIC4Q8N9L1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZIC4Q8N9L1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZIC4Q8N9L1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZIC4Q8N9L1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZIC4Q8N9L1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZIC4Q8N9L1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZIC4Q8N9L1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZIC4Q8N9L1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZIC4Q8N9L1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZIC4Q8N9L1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ZIC4Q8N9L1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZIC4Q8N9L1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZIC4Q8N9L1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ZIC4Q8N9L1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZIC4Q8N9L1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZIC4Q8N9L1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ZIC4Q8N9L1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ZIC4Q8N9L1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ZIC4Q8N9L1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZIC4Q8N9L1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZIC4Q8N9L1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZIC4Q8N9L1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZIC4Q8N9L1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ZIC4Q8N9L1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZIC4Q8N9L1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZIC4Q8N9L1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZIC4Q8N9L1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZIC4Q8N9L1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZIC4Q8N9L1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZIC4Q8N9L1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZIC4Q8N9L1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZIC4Q8N9L1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ZIC4Q8N9L1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZIC4Q8N9L1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZIC4Q8N9L1 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZIC4Q8N9L1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZIC4Q8N9L1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ZIC4Q8N9L1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZIC4Q8N9L1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZIC4Q8N9L1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZIC4Q8N9L1 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZIC4Q8N9L1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZIC4Q8N9L1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZIC4Q8N9L1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZIC4Q8N9L1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZIC4Q8N9L1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZIC4Q8N9L1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ZIC4Q8N9L1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZIC4Q8N9L1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZIC4Q8N9L1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZIC4Q8N9L1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZIC4Q8N9L1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms