Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2M8

CLASRP, CLK4-associating serine/arginine rich protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLASRPQ8N2M8 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLASRPQ8N2M8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLASRPQ8N2M8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLASRPQ8N2M8 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CLASRPQ8N2M8 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
CLASRPQ8N2M8 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CLASRPQ8N2M8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CLASRPQ8N2M8 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLASRPQ8N2M8 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLASRPQ8N2M8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLASRPQ8N2M8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLASRPQ8N2M8 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLASRPQ8N2M8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLASRPQ8N2M8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLASRPQ8N2M8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLASRPQ8N2M8 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLASRPQ8N2M8 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLASRPQ8N2M8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLASRPQ8N2M8 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLASRPQ8N2M8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLASRPQ8N2M8 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CLASRPQ8N2M8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLASRPQ8N2M8 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLASRPQ8N2M8 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLASRPQ8N2M8 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLASRPQ8N2M8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLASRPQ8N2M8 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLASRPQ8N2M8 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLASRPQ8N2M8 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLASRPQ8N2M8 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLASRPQ8N2M8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLASRPQ8N2M8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLASRPQ8N2M8 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLASRPQ8N2M8 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLASRPQ8N2M8 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLASRPQ8N2M8 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLASRPQ8N2M8 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLASRPQ8N2M8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CLASRPQ8N2M8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CLASRPQ8N2M8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLASRPQ8N2M8 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLASRPQ8N2M8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLASRPQ8N2M8 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLASRPQ8N2M8 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLASRPQ8N2M8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLASRPQ8N2M8 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLASRPQ8N2M8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLASRPQ8N2M8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLASRPQ8N2M8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLASRPQ8N2M8 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLASRPQ8N2M8 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLASRPQ8N2M8 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLASRPQ8N2M8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLASRPQ8N2M8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLASRPQ8N2M8 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLASRPQ8N2M8 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLASRPQ8N2M8 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLASRPQ8N2M8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CLASRPQ8N2M8 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLASRPQ8N2M8 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CLASRPQ8N2M8 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLASRPQ8N2M8 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLASRPQ8N2M8 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLASRPQ8N2M8 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLASRPQ8N2M8 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CLASRPQ8N2M8 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CLASRPQ8N2M8 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CLASRPQ8N2M8 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLASRPQ8N2M8 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLASRPQ8N2M8 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLASRPQ8N2M8 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLASRPQ8N2M8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLASRPQ8N2M8 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLASRPQ8N2M8 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLASRPQ8N2M8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLASRPQ8N2M8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLASRPQ8N2M8 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLASRPQ8N2M8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLASRPQ8N2M8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLASRPQ8N2M8 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLASRPQ8N2M8 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLASRPQ8N2M8 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLASRPQ8N2M8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLASRPQ8N2M8 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLASRPQ8N2M8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CLASRPQ8N2M8 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLASRPQ8N2M8 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLASRPQ8N2M8 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLASRPQ8N2M8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLASRPQ8N2M8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLASRPQ8N2M8 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLASRPQ8N2M8 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLASRPQ8N2M8 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLASRPQ8N2M8 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLASRPQ8N2M8 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLASRPQ8N2M8 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLASRPQ8N2M8 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLASRPQ8N2M8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLASRPQ8N2M8 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLASRPQ8N2M8 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms