Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0Z3

SPICE1, Spindle and centriole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPICE1Q8N0Z3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPICE1Q8N0Z3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPICE1Q8N0Z3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPICE1Q8N0Z3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPICE1Q8N0Z3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPICE1Q8N0Z3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPICE1Q8N0Z3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPICE1Q8N0Z3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPICE1Q8N0Z3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPICE1Q8N0Z3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPICE1Q8N0Z3 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPICE1Q8N0Z3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPICE1Q8N0Z3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPICE1Q8N0Z3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPICE1Q8N0Z3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPICE1Q8N0Z3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPICE1Q8N0Z3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPICE1Q8N0Z3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SPICE1Q8N0Z3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SPICE1Q8N0Z3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPICE1Q8N0Z3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPICE1Q8N0Z3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPICE1Q8N0Z3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPICE1Q8N0Z3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPICE1Q8N0Z3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPICE1Q8N0Z3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPICE1Q8N0Z3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPICE1Q8N0Z3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPICE1Q8N0Z3 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPICE1Q8N0Z3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPICE1Q8N0Z3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPICE1Q8N0Z3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPICE1Q8N0Z3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPICE1Q8N0Z3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPICE1Q8N0Z3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPICE1Q8N0Z3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPICE1Q8N0Z3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPICE1Q8N0Z3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SPICE1Q8N0Z3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SPICE1Q8N0Z3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPICE1Q8N0Z3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPICE1Q8N0Z3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPICE1Q8N0Z3 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPICE1Q8N0Z3 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SPICE1Q8N0Z3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPICE1Q8N0Z3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPICE1Q8N0Z3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SPICE1Q8N0Z3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPICE1Q8N0Z3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPICE1Q8N0Z3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPICE1Q8N0Z3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPICE1Q8N0Z3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPICE1Q8N0Z3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPICE1Q8N0Z3 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SPICE1Q8N0Z3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPICE1Q8N0Z3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPICE1Q8N0Z3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPICE1Q8N0Z3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPICE1Q8N0Z3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPICE1Q8N0Z3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPICE1Q8N0Z3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPICE1Q8N0Z3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPICE1Q8N0Z3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPICE1Q8N0Z3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPICE1Q8N0Z3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPICE1Q8N0Z3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPICE1Q8N0Z3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPICE1Q8N0Z3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPICE1Q8N0Z3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPICE1Q8N0Z3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPICE1Q8N0Z3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPICE1Q8N0Z3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPICE1Q8N0Z3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPICE1Q8N0Z3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SPICE1Q8N0Z3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPICE1Q8N0Z3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPICE1Q8N0Z3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPICE1Q8N0Z3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPICE1Q8N0Z3 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPICE1Q8N0Z3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPICE1Q8N0Z3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPICE1Q8N0Z3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPICE1Q8N0Z3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPICE1Q8N0Z3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPICE1Q8N0Z3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPICE1Q8N0Z3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPICE1Q8N0Z3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SPICE1Q8N0Z3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPICE1Q8N0Z3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SPICE1Q8N0Z3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPICE1Q8N0Z3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPICE1Q8N0Z3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPICE1Q8N0Z3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPICE1Q8N0Z3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPICE1Q8N0Z3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPICE1Q8N0Z3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPICE1Q8N0Z3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPICE1Q8N0Z3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPICE1Q8N0Z3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPICE1Q8N0Z3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms