Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HERC6Q8IVU3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HERC6Q8IVU3 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HERC6Q8IVU3 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HERC6Q8IVU3 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HERC6Q8IVU3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HERC6Q8IVU3 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HERC6Q8IVU3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HERC6Q8IVU3 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HERC6Q8IVU3 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HERC6Q8IVU3 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HERC6Q8IVU3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HERC6Q8IVU3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HERC6Q8IVU3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HERC6Q8IVU3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HERC6Q8IVU3 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HERC6Q8IVU3 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HERC6Q8IVU3 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HERC6Q8IVU3 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HERC6Q8IVU3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HERC6Q8IVU3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HERC6Q8IVU3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HERC6Q8IVU3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HERC6Q8IVU3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HERC6Q8IVU3 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HERC6Q8IVU3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HERC6Q8IVU3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HERC6Q8IVU3 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HERC6Q8IVU3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
HERC6Q8IVU3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HERC6Q8IVU3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HERC6Q8IVU3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HERC6Q8IVU3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
HERC6Q8IVU3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HERC6Q8IVU3 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
HERC6Q8IVU3 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HERC6Q8IVU3 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HERC6Q8IVU3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HERC6Q8IVU3 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HERC6Q8IVU3 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HERC6Q8IVU3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HERC6Q8IVU3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HERC6Q8IVU3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HERC6Q8IVU3 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HERC6Q8IVU3 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HERC6Q8IVU3 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HERC6Q8IVU3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HERC6Q8IVU3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HERC6Q8IVU3 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HERC6Q8IVU3 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HERC6Q8IVU3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HERC6Q8IVU3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HERC6Q8IVU3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HERC6Q8IVU3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HERC6Q8IVU3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HERC6Q8IVU3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
HERC6Q8IVU3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HERC6Q8IVU3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HERC6Q8IVU3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HERC6Q8IVU3 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HERC6Q8IVU3 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HERC6Q8IVU3 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
HERC6Q8IVU3 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
HERC6Q8IVU3 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HERC6Q8IVU3 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HERC6Q8IVU3 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HERC6Q8IVU3 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HERC6Q8IVU3 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
HERC6Q8IVU3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HERC6Q8IVU3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HERC6Q8IVU3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HERC6Q8IVU3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HERC6Q8IVU3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HERC6Q8IVU3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HERC6Q8IVU3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HERC6Q8IVU3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HERC6Q8IVU3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HERC6Q8IVU3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HERC6Q8IVU3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HERC6Q8IVU3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HERC6Q8IVU3 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HERC6Q8IVU3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HERC6Q8IVU3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HERC6Q8IVU3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HERC6Q8IVU3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HERC6Q8IVU3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HERC6Q8IVU3 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HERC6Q8IVU3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HERC6Q8IVU3 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HERC6Q8IVU3 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HERC6Q8IVU3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HERC6Q8IVU3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HERC6Q8IVU3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HERC6Q8IVU3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HERC6Q8IVU3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HERC6Q8IVU3 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HERC6Q8IVU3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HERC6Q8IVU3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HERC6Q8IVU3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HERC6Q8IVU3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms