Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC50Q8IVM0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC50Q8IVM0 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC50Q8IVM0 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC50Q8IVM0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC50Q8IVM0 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC50Q8IVM0 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC50Q8IVM0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC50Q8IVM0 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC50Q8IVM0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC50Q8IVM0 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC50Q8IVM0 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC50Q8IVM0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC50Q8IVM0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC50Q8IVM0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC50Q8IVM0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC50Q8IVM0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC50Q8IVM0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC50Q8IVM0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC50Q8IVM0 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC50Q8IVM0 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC50Q8IVM0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC50Q8IVM0 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC50Q8IVM0 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC50Q8IVM0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC50Q8IVM0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC50Q8IVM0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC50Q8IVM0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC50Q8IVM0 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC50Q8IVM0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC50Q8IVM0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC50Q8IVM0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC50Q8IVM0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC50Q8IVM0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC50Q8IVM0 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC50Q8IVM0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC50Q8IVM0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC50Q8IVM0 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC50Q8IVM0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC50Q8IVM0 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC50Q8IVM0 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC50Q8IVM0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC50Q8IVM0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC50Q8IVM0 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC50Q8IVM0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC50Q8IVM0 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC50Q8IVM0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC50Q8IVM0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC50Q8IVM0 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC50Q8IVM0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC50Q8IVM0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC50Q8IVM0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC50Q8IVM0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC50Q8IVM0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC50Q8IVM0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC50Q8IVM0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC50Q8IVM0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC50Q8IVM0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC50Q8IVM0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC50Q8IVM0 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC50Q8IVM0 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC50Q8IVM0 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC50Q8IVM0 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC50Q8IVM0 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC50Q8IVM0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC50Q8IVM0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC50Q8IVM0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC50Q8IVM0 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC50Q8IVM0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC50Q8IVM0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC50Q8IVM0 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC50Q8IVM0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC50Q8IVM0 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC50Q8IVM0 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC50Q8IVM0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC50Q8IVM0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC50Q8IVM0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC50Q8IVM0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC50Q8IVM0 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC50Q8IVM0 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC50Q8IVM0 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC50Q8IVM0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC50Q8IVM0 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC50Q8IVM0 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC50Q8IVM0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC50Q8IVM0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC50Q8IVM0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC50Q8IVM0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC50Q8IVM0 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC50Q8IVM0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC50Q8IVM0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC50Q8IVM0 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC50Q8IVM0 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC50Q8IVM0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC50Q8IVM0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC50Q8IVM0 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC50Q8IVM0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC50Q8IVM0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC50Q8IVM0 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC50Q8IVM0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms