Protein–RNA interactions for Protein: Q86U86

PBRM1, Protein polybromo-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1Q86U86 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
PBRM1Q86U86 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
PBRM1Q86U86 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
PBRM1Q86U86 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
PBRM1Q86U86 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
PBRM1Q86U86 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
PBRM1Q86U86 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
PBRM1Q86U86 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
PBRM1Q86U86 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC36.14■■■■□ 3.38
PBRM1Q86U86 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
PBRM1Q86U86 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
PBRM1Q86U86 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
PBRM1Q86U86 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.38
PBRM1Q86U86 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
PBRM1Q86U86 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
PBRM1Q86U86 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
PBRM1Q86U86 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
PBRM1Q86U86 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
PBRM1Q86U86 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
PBRM1Q86U86 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
PBRM1Q86U86 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
PBRM1Q86U86 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
PBRM1Q86U86 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
PBRM1Q86U86 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
PBRM1Q86U86 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
PBRM1Q86U86 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
PBRM1Q86U86 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
PBRM1Q86U86 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
PBRM1Q86U86 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC36.11■■■■□ 3.37
PBRM1Q86U86 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
PBRM1Q86U86 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
PBRM1Q86U86 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
PBRM1Q86U86 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
PBRM1Q86U86 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
PBRM1Q86U86 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
PBRM1Q86U86 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
PBRM1Q86U86 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
PBRM1Q86U86 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
PBRM1Q86U86 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
PBRM1Q86U86 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
PBRM1Q86U86 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC36.1■■■■□ 3.37
PBRM1Q86U86 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
PBRM1Q86U86 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
PBRM1Q86U86 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
PBRM1Q86U86 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
PBRM1Q86U86 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC36.1■■■■□ 3.37
PBRM1Q86U86 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
PBRM1Q86U86 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
PBRM1Q86U86 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
PBRM1Q86U86 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
PBRM1Q86U86 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
PBRM1Q86U86 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
PBRM1Q86U86 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
PBRM1Q86U86 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
PBRM1Q86U86 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
PBRM1Q86U86 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
PBRM1Q86U86 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
PBRM1Q86U86 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.37
PBRM1Q86U86 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
PBRM1Q86U86 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
PBRM1Q86U86 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
PBRM1Q86U86 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
PBRM1Q86U86 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
PBRM1Q86U86 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
PBRM1Q86U86 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
PBRM1Q86U86 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
PBRM1Q86U86 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC36.06■■■■□ 3.36
PBRM1Q86U86 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
PBRM1Q86U86 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
PBRM1Q86U86 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
PBRM1Q86U86 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
PBRM1Q86U86 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
PBRM1Q86U86 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
PBRM1Q86U86 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
PBRM1Q86U86 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
PBRM1Q86U86 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
PBRM1Q86U86 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
PBRM1Q86U86 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
PBRM1Q86U86 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.04■■■■□ 3.36
PBRM1Q86U86 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
PBRM1Q86U86 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
PBRM1Q86U86 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC36.03■■■■□ 3.36
PBRM1Q86U86 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
PBRM1Q86U86 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
PBRM1Q86U86 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
PBRM1Q86U86 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
PBRM1Q86U86 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
PBRM1Q86U86 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
PBRM1Q86U86 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
PBRM1Q86U86 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
PBRM1Q86U86 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
PBRM1Q86U86 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
PBRM1Q86U86 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
PBRM1Q86U86 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
PBRM1Q86U86 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
PBRM1Q86U86 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
PBRM1Q86U86 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
PBRM1Q86U86 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
PBRM1Q86U86 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
PBRM1Q86U86 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms