Protein–RNA interactions for Protein: Q86SE9

PCGF5, Polycomb group RING finger protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF5Q86SE9 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCGF5Q86SE9 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCGF5Q86SE9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCGF5Q86SE9 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCGF5Q86SE9 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCGF5Q86SE9 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PCGF5Q86SE9 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCGF5Q86SE9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCGF5Q86SE9 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCGF5Q86SE9 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCGF5Q86SE9 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCGF5Q86SE9 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCGF5Q86SE9 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCGF5Q86SE9 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCGF5Q86SE9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCGF5Q86SE9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PCGF5Q86SE9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCGF5Q86SE9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PCGF5Q86SE9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCGF5Q86SE9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCGF5Q86SE9 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCGF5Q86SE9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCGF5Q86SE9 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PCGF5Q86SE9 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCGF5Q86SE9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCGF5Q86SE9 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCGF5Q86SE9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCGF5Q86SE9 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCGF5Q86SE9 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCGF5Q86SE9 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCGF5Q86SE9 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCGF5Q86SE9 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCGF5Q86SE9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCGF5Q86SE9 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCGF5Q86SE9 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCGF5Q86SE9 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCGF5Q86SE9 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCGF5Q86SE9 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCGF5Q86SE9 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCGF5Q86SE9 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCGF5Q86SE9 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCGF5Q86SE9 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCGF5Q86SE9 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCGF5Q86SE9 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCGF5Q86SE9 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCGF5Q86SE9 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCGF5Q86SE9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCGF5Q86SE9 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCGF5Q86SE9 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCGF5Q86SE9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCGF5Q86SE9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCGF5Q86SE9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCGF5Q86SE9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCGF5Q86SE9 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCGF5Q86SE9 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCGF5Q86SE9 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCGF5Q86SE9 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PCGF5Q86SE9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PCGF5Q86SE9 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCGF5Q86SE9 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCGF5Q86SE9 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCGF5Q86SE9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCGF5Q86SE9 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCGF5Q86SE9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCGF5Q86SE9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PCGF5Q86SE9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PCGF5Q86SE9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCGF5Q86SE9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCGF5Q86SE9 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCGF5Q86SE9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCGF5Q86SE9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PCGF5Q86SE9 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PCGF5Q86SE9 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PCGF5Q86SE9 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PCGF5Q86SE9 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCGF5Q86SE9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCGF5Q86SE9 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCGF5Q86SE9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCGF5Q86SE9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCGF5Q86SE9 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCGF5Q86SE9 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCGF5Q86SE9 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCGF5Q86SE9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCGF5Q86SE9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCGF5Q86SE9 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCGF5Q86SE9 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCGF5Q86SE9 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCGF5Q86SE9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCGF5Q86SE9 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCGF5Q86SE9 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCGF5Q86SE9 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCGF5Q86SE9 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCGF5Q86SE9 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCGF5Q86SE9 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCGF5Q86SE9 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCGF5Q86SE9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCGF5Q86SE9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCGF5Q86SE9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PCGF5Q86SE9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PCGF5Q86SE9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms