Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z614

SNX20, Sorting nexin-20, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX20Q7Z614 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SNX20Q7Z614 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNX20Q7Z614 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNX20Q7Z614 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNX20Q7Z614 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNX20Q7Z614 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNX20Q7Z614 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNX20Q7Z614 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNX20Q7Z614 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX20Q7Z614 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX20Q7Z614 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX20Q7Z614 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX20Q7Z614 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX20Q7Z614 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX20Q7Z614 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX20Q7Z614 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX20Q7Z614 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX20Q7Z614 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX20Q7Z614 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX20Q7Z614 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX20Q7Z614 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX20Q7Z614 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX20Q7Z614 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX20Q7Z614 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX20Q7Z614 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX20Q7Z614 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX20Q7Z614 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX20Q7Z614 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX20Q7Z614 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX20Q7Z614 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX20Q7Z614 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX20Q7Z614 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX20Q7Z614 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX20Q7Z614 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX20Q7Z614 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX20Q7Z614 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX20Q7Z614 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX20Q7Z614 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX20Q7Z614 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX20Q7Z614 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX20Q7Z614 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX20Q7Z614 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX20Q7Z614 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX20Q7Z614 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX20Q7Z614 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX20Q7Z614 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX20Q7Z614 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX20Q7Z614 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX20Q7Z614 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX20Q7Z614 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX20Q7Z614 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX20Q7Z614 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX20Q7Z614 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX20Q7Z614 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX20Q7Z614 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX20Q7Z614 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX20Q7Z614 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX20Q7Z614 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX20Q7Z614 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX20Q7Z614 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX20Q7Z614 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX20Q7Z614 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX20Q7Z614 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX20Q7Z614 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX20Q7Z614 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX20Q7Z614 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX20Q7Z614 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX20Q7Z614 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX20Q7Z614 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX20Q7Z614 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX20Q7Z614 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX20Q7Z614 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX20Q7Z614 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX20Q7Z614 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX20Q7Z614 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX20Q7Z614 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX20Q7Z614 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX20Q7Z614 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX20Q7Z614 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX20Q7Z614 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX20Q7Z614 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX20Q7Z614 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX20Q7Z614 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX20Q7Z614 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX20Q7Z614 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX20Q7Z614 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX20Q7Z614 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX20Q7Z614 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SNX20Q7Z614 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SNX20Q7Z614 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SNX20Q7Z614 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SNX20Q7Z614 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX20Q7Z614 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX20Q7Z614 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX20Q7Z614 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX20Q7Z614 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX20Q7Z614 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX20Q7Z614 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX20Q7Z614 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX20Q7Z614 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms