Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z4L9

PPP1R42, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 42, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R42Q7Z4L9 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PPP1R42Q7Z4L9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PPP1R42Q7Z4L9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PPP1R42Q7Z4L9 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PPP1R42Q7Z4L9 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PPP1R42Q7Z4L9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PPP1R42Q7Z4L9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PPP1R42Q7Z4L9 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PPP1R42Q7Z4L9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PPP1R42Q7Z4L9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PPP1R42Q7Z4L9 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PPP1R42Q7Z4L9 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PPP1R42Q7Z4L9 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PPP1R42Q7Z4L9 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PPP1R42Q7Z4L9 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PPP1R42Q7Z4L9 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PPP1R42Q7Z4L9 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PPP1R42Q7Z4L9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PPP1R42Q7Z4L9 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PPP1R42Q7Z4L9 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PPP1R42Q7Z4L9 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PPP1R42Q7Z4L9 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PPP1R42Q7Z4L9 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PPP1R42Q7Z4L9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PPP1R42Q7Z4L9 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPP1R42Q7Z4L9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPP1R42Q7Z4L9 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPP1R42Q7Z4L9 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPP1R42Q7Z4L9 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PPP1R42Q7Z4L9 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPP1R42Q7Z4L9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPP1R42Q7Z4L9 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPP1R42Q7Z4L9 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPP1R42Q7Z4L9 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPP1R42Q7Z4L9 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPP1R42Q7Z4L9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPP1R42Q7Z4L9 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPP1R42Q7Z4L9 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PPP1R42Q7Z4L9 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PPP1R42Q7Z4L9 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PPP1R42Q7Z4L9 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PPP1R42Q7Z4L9 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PPP1R42Q7Z4L9 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PPP1R42Q7Z4L9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PPP1R42Q7Z4L9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PPP1R42Q7Z4L9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PPP1R42Q7Z4L9 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PPP1R42Q7Z4L9 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PPP1R42Q7Z4L9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PPP1R42Q7Z4L9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPP1R42Q7Z4L9 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPP1R42Q7Z4L9 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPP1R42Q7Z4L9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPP1R42Q7Z4L9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPP1R42Q7Z4L9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPP1R42Q7Z4L9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPP1R42Q7Z4L9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PPP1R42Q7Z4L9 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PPP1R42Q7Z4L9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PPP1R42Q7Z4L9 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PPP1R42Q7Z4L9 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PPP1R42Q7Z4L9 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PPP1R42Q7Z4L9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PPP1R42Q7Z4L9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PPP1R42Q7Z4L9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PPP1R42Q7Z4L9 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PPP1R42Q7Z4L9 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PPP1R42Q7Z4L9 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PPP1R42Q7Z4L9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PPP1R42Q7Z4L9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PPP1R42Q7Z4L9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PPP1R42Q7Z4L9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PPP1R42Q7Z4L9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PPP1R42Q7Z4L9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PPP1R42Q7Z4L9 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PPP1R42Q7Z4L9 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PPP1R42Q7Z4L9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PPP1R42Q7Z4L9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PPP1R42Q7Z4L9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PPP1R42Q7Z4L9 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PPP1R42Q7Z4L9 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
PPP1R42Q7Z4L9 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PPP1R42Q7Z4L9 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PPP1R42Q7Z4L9 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PPP1R42Q7Z4L9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PPP1R42Q7Z4L9 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PPP1R42Q7Z4L9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PPP1R42Q7Z4L9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PPP1R42Q7Z4L9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PPP1R42Q7Z4L9 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
PPP1R42Q7Z4L9 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PPP1R42Q7Z4L9 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PPP1R42Q7Z4L9 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PPP1R42Q7Z4L9 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PPP1R42Q7Z4L9 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PPP1R42Q7Z4L9 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PPP1R42Q7Z4L9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PPP1R42Q7Z4L9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PPP1R42Q7Z4L9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PPP1R42Q7Z4L9 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms