Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z404

TMC4, Transmembrane channel-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC4Q7Z404 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMC4Q7Z404 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMC4Q7Z404 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMC4Q7Z404 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TMC4Q7Z404 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMC4Q7Z404 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMC4Q7Z404 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMC4Q7Z404 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMC4Q7Z404 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMC4Q7Z404 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMC4Q7Z404 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMC4Q7Z404 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMC4Q7Z404 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMC4Q7Z404 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMC4Q7Z404 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMC4Q7Z404 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMC4Q7Z404 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMC4Q7Z404 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMC4Q7Z404 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMC4Q7Z404 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMC4Q7Z404 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMC4Q7Z404 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMC4Q7Z404 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMC4Q7Z404 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMC4Q7Z404 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMC4Q7Z404 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMC4Q7Z404 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMC4Q7Z404 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMC4Q7Z404 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMC4Q7Z404 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMC4Q7Z404 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMC4Q7Z404 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMC4Q7Z404 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMC4Q7Z404 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMC4Q7Z404 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMC4Q7Z404 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMC4Q7Z404 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
TMC4Q7Z404 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMC4Q7Z404 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TMC4Q7Z404 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMC4Q7Z404 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMC4Q7Z404 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMC4Q7Z404 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMC4Q7Z404 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMC4Q7Z404 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMC4Q7Z404 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMC4Q7Z404 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMC4Q7Z404 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMC4Q7Z404 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMC4Q7Z404 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMC4Q7Z404 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMC4Q7Z404 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMC4Q7Z404 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMC4Q7Z404 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMC4Q7Z404 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMC4Q7Z404 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TMC4Q7Z404 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMC4Q7Z404 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TMC4Q7Z404 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMC4Q7Z404 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMC4Q7Z404 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMC4Q7Z404 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMC4Q7Z404 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMC4Q7Z404 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMC4Q7Z404 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMC4Q7Z404 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TMC4Q7Z404 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMC4Q7Z404 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMC4Q7Z404 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TMC4Q7Z404 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMC4Q7Z404 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMC4Q7Z404 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMC4Q7Z404 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMC4Q7Z404 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMC4Q7Z404 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMC4Q7Z404 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMC4Q7Z404 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
TMC4Q7Z404 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMC4Q7Z404 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMC4Q7Z404 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMC4Q7Z404 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMC4Q7Z404 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMC4Q7Z404 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMC4Q7Z404 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMC4Q7Z404 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMC4Q7Z404 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMC4Q7Z404 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMC4Q7Z404 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMC4Q7Z404 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMC4Q7Z404 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
TMC4Q7Z404 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMC4Q7Z404 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMC4Q7Z404 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMC4Q7Z404 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMC4Q7Z404 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMC4Q7Z404 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMC4Q7Z404 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMC4Q7Z404 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMC4Q7Z404 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMC4Q7Z404 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms