Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3V4

UBE3B, Ubiquitin-protein ligase E3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3BQ7Z3V4 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
UBE3BQ7Z3V4 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
UBE3BQ7Z3V4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
UBE3BQ7Z3V4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
UBE3BQ7Z3V4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
UBE3BQ7Z3V4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
UBE3BQ7Z3V4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
UBE3BQ7Z3V4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
UBE3BQ7Z3V4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
UBE3BQ7Z3V4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
UBE3BQ7Z3V4 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
UBE3BQ7Z3V4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
UBE3BQ7Z3V4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
UBE3BQ7Z3V4 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
UBE3BQ7Z3V4 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
UBE3BQ7Z3V4 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
UBE3BQ7Z3V4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
UBE3BQ7Z3V4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
UBE3BQ7Z3V4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
UBE3BQ7Z3V4 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
UBE3BQ7Z3V4 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
UBE3BQ7Z3V4 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
UBE3BQ7Z3V4 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
UBE3BQ7Z3V4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
UBE3BQ7Z3V4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
UBE3BQ7Z3V4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
UBE3BQ7Z3V4 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
UBE3BQ7Z3V4 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
UBE3BQ7Z3V4 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
UBE3BQ7Z3V4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
UBE3BQ7Z3V4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
UBE3BQ7Z3V4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
UBE3BQ7Z3V4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
UBE3BQ7Z3V4 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
UBE3BQ7Z3V4 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
UBE3BQ7Z3V4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
UBE3BQ7Z3V4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
UBE3BQ7Z3V4 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
UBE3BQ7Z3V4 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
UBE3BQ7Z3V4 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
UBE3BQ7Z3V4 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
UBE3BQ7Z3V4 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
UBE3BQ7Z3V4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
UBE3BQ7Z3V4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
UBE3BQ7Z3V4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
UBE3BQ7Z3V4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
UBE3BQ7Z3V4 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
UBE3BQ7Z3V4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
UBE3BQ7Z3V4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
UBE3BQ7Z3V4 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
UBE3BQ7Z3V4 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
UBE3BQ7Z3V4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
UBE3BQ7Z3V4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
UBE3BQ7Z3V4 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
UBE3BQ7Z3V4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
UBE3BQ7Z3V4 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
UBE3BQ7Z3V4 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
UBE3BQ7Z3V4 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
UBE3BQ7Z3V4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
UBE3BQ7Z3V4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
UBE3BQ7Z3V4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
UBE3BQ7Z3V4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
UBE3BQ7Z3V4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
UBE3BQ7Z3V4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
UBE3BQ7Z3V4 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
UBE3BQ7Z3V4 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
UBE3BQ7Z3V4 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
UBE3BQ7Z3V4 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
UBE3BQ7Z3V4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
UBE3BQ7Z3V4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
UBE3BQ7Z3V4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
UBE3BQ7Z3V4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
UBE3BQ7Z3V4 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
UBE3BQ7Z3V4 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
UBE3BQ7Z3V4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
UBE3BQ7Z3V4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
UBE3BQ7Z3V4 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
UBE3BQ7Z3V4 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
UBE3BQ7Z3V4 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
UBE3BQ7Z3V4 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
UBE3BQ7Z3V4 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
UBE3BQ7Z3V4 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
UBE3BQ7Z3V4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
UBE3BQ7Z3V4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
UBE3BQ7Z3V4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
UBE3BQ7Z3V4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
UBE3BQ7Z3V4 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
UBE3BQ7Z3V4 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
UBE3BQ7Z3V4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
UBE3BQ7Z3V4 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
UBE3BQ7Z3V4 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
UBE3BQ7Z3V4 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
UBE3BQ7Z3V4 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
UBE3BQ7Z3V4 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
UBE3BQ7Z3V4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
UBE3BQ7Z3V4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
UBE3BQ7Z3V4 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
UBE3BQ7Z3V4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
UBE3BQ7Z3V4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
UBE3BQ7Z3V4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms