Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTN6

STRADA, STE20-related kinase adapter protein alpha, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADAQ7RTN6 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
STRADAQ7RTN6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
STRADAQ7RTN6 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
STRADAQ7RTN6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
STRADAQ7RTN6 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
STRADAQ7RTN6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
STRADAQ7RTN6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
STRADAQ7RTN6 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
STRADAQ7RTN6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
STRADAQ7RTN6 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
STRADAQ7RTN6 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
STRADAQ7RTN6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
STRADAQ7RTN6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
STRADAQ7RTN6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
STRADAQ7RTN6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
STRADAQ7RTN6 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
STRADAQ7RTN6 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
STRADAQ7RTN6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
STRADAQ7RTN6 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
STRADAQ7RTN6 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
STRADAQ7RTN6 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
STRADAQ7RTN6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
STRADAQ7RTN6 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
STRADAQ7RTN6 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
STRADAQ7RTN6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
STRADAQ7RTN6 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
STRADAQ7RTN6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
STRADAQ7RTN6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
STRADAQ7RTN6 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
STRADAQ7RTN6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
STRADAQ7RTN6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
STRADAQ7RTN6 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
STRADAQ7RTN6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
STRADAQ7RTN6 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
STRADAQ7RTN6 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
STRADAQ7RTN6 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
STRADAQ7RTN6 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
STRADAQ7RTN6 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
STRADAQ7RTN6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
STRADAQ7RTN6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
STRADAQ7RTN6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
STRADAQ7RTN6 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
STRADAQ7RTN6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
STRADAQ7RTN6 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
STRADAQ7RTN6 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
STRADAQ7RTN6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
STRADAQ7RTN6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
STRADAQ7RTN6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
STRADAQ7RTN6 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
STRADAQ7RTN6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
STRADAQ7RTN6 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
STRADAQ7RTN6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
STRADAQ7RTN6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
STRADAQ7RTN6 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
STRADAQ7RTN6 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
STRADAQ7RTN6 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
STRADAQ7RTN6 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
STRADAQ7RTN6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
STRADAQ7RTN6 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
STRADAQ7RTN6 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
STRADAQ7RTN6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
STRADAQ7RTN6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
STRADAQ7RTN6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
STRADAQ7RTN6 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
STRADAQ7RTN6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
STRADAQ7RTN6 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
STRADAQ7RTN6 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
STRADAQ7RTN6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
STRADAQ7RTN6 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
STRADAQ7RTN6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
STRADAQ7RTN6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
STRADAQ7RTN6 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
STRADAQ7RTN6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
STRADAQ7RTN6 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
STRADAQ7RTN6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
STRADAQ7RTN6 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
STRADAQ7RTN6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
STRADAQ7RTN6 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
STRADAQ7RTN6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
STRADAQ7RTN6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
STRADAQ7RTN6 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
STRADAQ7RTN6 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
STRADAQ7RTN6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
STRADAQ7RTN6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
STRADAQ7RTN6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
STRADAQ7RTN6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
STRADAQ7RTN6 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
STRADAQ7RTN6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
STRADAQ7RTN6 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
STRADAQ7RTN6 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
STRADAQ7RTN6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
STRADAQ7RTN6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
STRADAQ7RTN6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
STRADAQ7RTN6 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
STRADAQ7RTN6 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
STRADAQ7RTN6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
STRADAQ7RTN6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
STRADAQ7RTN6 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
STRADAQ7RTN6 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
STRADAQ7RTN6 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms