Protein–RNA interactions for Protein: Q7LC44

ARC, Activity-regulated cytoskeleton-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARCQ7LC44 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARCQ7LC44 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARCQ7LC44 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARCQ7LC44 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARCQ7LC44 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARCQ7LC44 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARCQ7LC44 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARCQ7LC44 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ARCQ7LC44 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARCQ7LC44 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARCQ7LC44 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARCQ7LC44 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARCQ7LC44 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARCQ7LC44 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARCQ7LC44 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARCQ7LC44 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARCQ7LC44 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARCQ7LC44 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARCQ7LC44 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ARCQ7LC44 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARCQ7LC44 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARCQ7LC44 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARCQ7LC44 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARCQ7LC44 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARCQ7LC44 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARCQ7LC44 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARCQ7LC44 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARCQ7LC44 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARCQ7LC44 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARCQ7LC44 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARCQ7LC44 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARCQ7LC44 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ARCQ7LC44 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARCQ7LC44 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARCQ7LC44 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARCQ7LC44 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARCQ7LC44 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARCQ7LC44 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARCQ7LC44 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARCQ7LC44 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARCQ7LC44 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ARCQ7LC44 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARCQ7LC44 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARCQ7LC44 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARCQ7LC44 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARCQ7LC44 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARCQ7LC44 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARCQ7LC44 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ARCQ7LC44 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ARCQ7LC44 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARCQ7LC44 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ARCQ7LC44 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARCQ7LC44 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARCQ7LC44 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARCQ7LC44 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARCQ7LC44 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARCQ7LC44 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARCQ7LC44 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARCQ7LC44 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARCQ7LC44 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARCQ7LC44 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARCQ7LC44 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARCQ7LC44 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARCQ7LC44 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARCQ7LC44 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ARCQ7LC44 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARCQ7LC44 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARCQ7LC44 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARCQ7LC44 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARCQ7LC44 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARCQ7LC44 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARCQ7LC44 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARCQ7LC44 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARCQ7LC44 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARCQ7LC44 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ARCQ7LC44 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARCQ7LC44 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARCQ7LC44 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ARCQ7LC44 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARCQ7LC44 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARCQ7LC44 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARCQ7LC44 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARCQ7LC44 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARCQ7LC44 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARCQ7LC44 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ARCQ7LC44 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARCQ7LC44 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARCQ7LC44 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARCQ7LC44 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARCQ7LC44 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ARCQ7LC44 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARCQ7LC44 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARCQ7LC44 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARCQ7LC44 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARCQ7LC44 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARCQ7LC44 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARCQ7LC44 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARCQ7LC44 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARCQ7LC44 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARCQ7LC44 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms