Protein–RNA interactions for Protein: Q7L5N7

LPCAT2, Lysophosphatidylcholine acyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPCAT2Q7L5N7 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LPCAT2Q7L5N7 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LPCAT2Q7L5N7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LPCAT2Q7L5N7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LPCAT2Q7L5N7 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LPCAT2Q7L5N7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LPCAT2Q7L5N7 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LPCAT2Q7L5N7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LPCAT2Q7L5N7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LPCAT2Q7L5N7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LPCAT2Q7L5N7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LPCAT2Q7L5N7 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LPCAT2Q7L5N7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LPCAT2Q7L5N7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LPCAT2Q7L5N7 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LPCAT2Q7L5N7 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LPCAT2Q7L5N7 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LPCAT2Q7L5N7 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LPCAT2Q7L5N7 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LPCAT2Q7L5N7 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LPCAT2Q7L5N7 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LPCAT2Q7L5N7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LPCAT2Q7L5N7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LPCAT2Q7L5N7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LPCAT2Q7L5N7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LPCAT2Q7L5N7 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LPCAT2Q7L5N7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LPCAT2Q7L5N7 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LPCAT2Q7L5N7 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LPCAT2Q7L5N7 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LPCAT2Q7L5N7 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LPCAT2Q7L5N7 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
LPCAT2Q7L5N7 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LPCAT2Q7L5N7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LPCAT2Q7L5N7 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LPCAT2Q7L5N7 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LPCAT2Q7L5N7 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LPCAT2Q7L5N7 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LPCAT2Q7L5N7 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LPCAT2Q7L5N7 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LPCAT2Q7L5N7 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LPCAT2Q7L5N7 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LPCAT2Q7L5N7 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LPCAT2Q7L5N7 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LPCAT2Q7L5N7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LPCAT2Q7L5N7 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LPCAT2Q7L5N7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LPCAT2Q7L5N7 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LPCAT2Q7L5N7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LPCAT2Q7L5N7 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LPCAT2Q7L5N7 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LPCAT2Q7L5N7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LPCAT2Q7L5N7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LPCAT2Q7L5N7 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LPCAT2Q7L5N7 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LPCAT2Q7L5N7 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LPCAT2Q7L5N7 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LPCAT2Q7L5N7 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LPCAT2Q7L5N7 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LPCAT2Q7L5N7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LPCAT2Q7L5N7 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LPCAT2Q7L5N7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LPCAT2Q7L5N7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LPCAT2Q7L5N7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LPCAT2Q7L5N7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LPCAT2Q7L5N7 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LPCAT2Q7L5N7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LPCAT2Q7L5N7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LPCAT2Q7L5N7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LPCAT2Q7L5N7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LPCAT2Q7L5N7 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LPCAT2Q7L5N7 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LPCAT2Q7L5N7 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LPCAT2Q7L5N7 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LPCAT2Q7L5N7 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LPCAT2Q7L5N7 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LPCAT2Q7L5N7 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LPCAT2Q7L5N7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LPCAT2Q7L5N7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LPCAT2Q7L5N7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LPCAT2Q7L5N7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LPCAT2Q7L5N7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LPCAT2Q7L5N7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LPCAT2Q7L5N7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LPCAT2Q7L5N7 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LPCAT2Q7L5N7 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LPCAT2Q7L5N7 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LPCAT2Q7L5N7 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LPCAT2Q7L5N7 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LPCAT2Q7L5N7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LPCAT2Q7L5N7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LPCAT2Q7L5N7 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LPCAT2Q7L5N7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LPCAT2Q7L5N7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LPCAT2Q7L5N7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LPCAT2Q7L5N7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LPCAT2Q7L5N7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LPCAT2Q7L5N7 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LPCAT2Q7L5N7 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LPCAT2Q7L5N7 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms