Protein–RNA interactions for Protein: Q76G19

PDZD4, PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD4Q76G19 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDZD4Q76G19 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDZD4Q76G19 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDZD4Q76G19 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDZD4Q76G19 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDZD4Q76G19 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDZD4Q76G19 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDZD4Q76G19 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDZD4Q76G19 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDZD4Q76G19 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDZD4Q76G19 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDZD4Q76G19 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDZD4Q76G19 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDZD4Q76G19 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDZD4Q76G19 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDZD4Q76G19 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDZD4Q76G19 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDZD4Q76G19 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDZD4Q76G19 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDZD4Q76G19 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDZD4Q76G19 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDZD4Q76G19 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDZD4Q76G19 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDZD4Q76G19 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDZD4Q76G19 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDZD4Q76G19 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PDZD4Q76G19 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDZD4Q76G19 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDZD4Q76G19 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDZD4Q76G19 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDZD4Q76G19 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDZD4Q76G19 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDZD4Q76G19 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDZD4Q76G19 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDZD4Q76G19 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDZD4Q76G19 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDZD4Q76G19 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDZD4Q76G19 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDZD4Q76G19 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PDZD4Q76G19 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PDZD4Q76G19 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PDZD4Q76G19 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PDZD4Q76G19 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDZD4Q76G19 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDZD4Q76G19 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDZD4Q76G19 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDZD4Q76G19 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDZD4Q76G19 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDZD4Q76G19 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDZD4Q76G19 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDZD4Q76G19 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDZD4Q76G19 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDZD4Q76G19 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDZD4Q76G19 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDZD4Q76G19 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDZD4Q76G19 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDZD4Q76G19 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDZD4Q76G19 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDZD4Q76G19 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDZD4Q76G19 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDZD4Q76G19 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDZD4Q76G19 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDZD4Q76G19 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDZD4Q76G19 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDZD4Q76G19 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDZD4Q76G19 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDZD4Q76G19 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDZD4Q76G19 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDZD4Q76G19 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDZD4Q76G19 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDZD4Q76G19 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDZD4Q76G19 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDZD4Q76G19 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDZD4Q76G19 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PDZD4Q76G19 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDZD4Q76G19 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDZD4Q76G19 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDZD4Q76G19 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDZD4Q76G19 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDZD4Q76G19 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDZD4Q76G19 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDZD4Q76G19 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDZD4Q76G19 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDZD4Q76G19 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDZD4Q76G19 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDZD4Q76G19 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDZD4Q76G19 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDZD4Q76G19 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDZD4Q76G19 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDZD4Q76G19 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDZD4Q76G19 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDZD4Q76G19 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDZD4Q76G19 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDZD4Q76G19 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDZD4Q76G19 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDZD4Q76G19 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDZD4Q76G19 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PDZD4Q76G19 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDZD4Q76G19 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDZD4Q76G19 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms