Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC9

SMIM5, Small integral membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM5Q71RC9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SMIM5Q71RC9 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SMIM5Q71RC9 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SMIM5Q71RC9 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
SMIM5Q71RC9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SMIM5Q71RC9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SMIM5Q71RC9 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SMIM5Q71RC9 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
SMIM5Q71RC9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMIM5Q71RC9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMIM5Q71RC9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMIM5Q71RC9 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMIM5Q71RC9 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMIM5Q71RC9 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMIM5Q71RC9 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SMIM5Q71RC9 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMIM5Q71RC9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMIM5Q71RC9 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMIM5Q71RC9 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMIM5Q71RC9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMIM5Q71RC9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMIM5Q71RC9 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMIM5Q71RC9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMIM5Q71RC9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMIM5Q71RC9 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMIM5Q71RC9 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMIM5Q71RC9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
SMIM5Q71RC9 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SMIM5Q71RC9 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SMIM5Q71RC9 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
SMIM5Q71RC9 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SMIM5Q71RC9 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SMIM5Q71RC9 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SMIM5Q71RC9 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SMIM5Q71RC9 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
SMIM5Q71RC9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SMIM5Q71RC9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SMIM5Q71RC9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SMIM5Q71RC9 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SMIM5Q71RC9 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SMIM5Q71RC9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SMIM5Q71RC9 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMIM5Q71RC9 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMIM5Q71RC9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMIM5Q71RC9 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SMIM5Q71RC9 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMIM5Q71RC9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMIM5Q71RC9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMIM5Q71RC9 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMIM5Q71RC9 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMIM5Q71RC9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMIM5Q71RC9 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMIM5Q71RC9 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SMIM5Q71RC9 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMIM5Q71RC9 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SMIM5Q71RC9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMIM5Q71RC9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMIM5Q71RC9 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMIM5Q71RC9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMIM5Q71RC9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMIM5Q71RC9 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMIM5Q71RC9 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMIM5Q71RC9 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMIM5Q71RC9 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMIM5Q71RC9 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SMIM5Q71RC9 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMIM5Q71RC9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMIM5Q71RC9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
SMIM5Q71RC9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SMIM5Q71RC9 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SMIM5Q71RC9 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SMIM5Q71RC9 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SMIM5Q71RC9 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SMIM5Q71RC9 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SMIM5Q71RC9 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SMIM5Q71RC9 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SMIM5Q71RC9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SMIM5Q71RC9 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SMIM5Q71RC9 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SMIM5Q71RC9 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SMIM5Q71RC9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SMIM5Q71RC9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SMIM5Q71RC9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
SMIM5Q71RC9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMIM5Q71RC9 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMIM5Q71RC9 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMIM5Q71RC9 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMIM5Q71RC9 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMIM5Q71RC9 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMIM5Q71RC9 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMIM5Q71RC9 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
SMIM5Q71RC9 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMIM5Q71RC9 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMIM5Q71RC9 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMIM5Q71RC9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMIM5Q71RC9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMIM5Q71RC9 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMIM5Q71RC9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMIM5Q71RC9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMIM5Q71RC9 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms