Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW49

PAXIP1, PAX-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,069 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXIP1Q6ZW49 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PAXIP1Q6ZW49 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PAXIP1Q6ZW49 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PAXIP1Q6ZW49 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PAXIP1Q6ZW49 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PAXIP1Q6ZW49 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PAXIP1Q6ZW49 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PAXIP1Q6ZW49 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PAXIP1Q6ZW49 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PAXIP1Q6ZW49 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PAXIP1Q6ZW49 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PAXIP1Q6ZW49 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PAXIP1Q6ZW49 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PAXIP1Q6ZW49 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PAXIP1Q6ZW49 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PAXIP1Q6ZW49 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PAXIP1Q6ZW49 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PAXIP1Q6ZW49 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PAXIP1Q6ZW49 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PAXIP1Q6ZW49 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PAXIP1Q6ZW49 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PAXIP1Q6ZW49 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PAXIP1Q6ZW49 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PAXIP1Q6ZW49 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PAXIP1Q6ZW49 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PAXIP1Q6ZW49 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PAXIP1Q6ZW49 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PAXIP1Q6ZW49 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PAXIP1Q6ZW49 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PAXIP1Q6ZW49 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PAXIP1Q6ZW49 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PAXIP1Q6ZW49 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PAXIP1Q6ZW49 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PAXIP1Q6ZW49 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PAXIP1Q6ZW49 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PAXIP1Q6ZW49 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PAXIP1Q6ZW49 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PAXIP1Q6ZW49 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PAXIP1Q6ZW49 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PAXIP1Q6ZW49 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PAXIP1Q6ZW49 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PAXIP1Q6ZW49 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PAXIP1Q6ZW49 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PAXIP1Q6ZW49 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PAXIP1Q6ZW49 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PAXIP1Q6ZW49 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PAXIP1Q6ZW49 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PAXIP1Q6ZW49 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PAXIP1Q6ZW49 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PAXIP1Q6ZW49 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PAXIP1Q6ZW49 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PAXIP1Q6ZW49 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PAXIP1Q6ZW49 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PAXIP1Q6ZW49 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PAXIP1Q6ZW49 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PAXIP1Q6ZW49 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PAXIP1Q6ZW49 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PAXIP1Q6ZW49 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PAXIP1Q6ZW49 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PAXIP1Q6ZW49 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PAXIP1Q6ZW49 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PAXIP1Q6ZW49 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PAXIP1Q6ZW49 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PAXIP1Q6ZW49 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PAXIP1Q6ZW49 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PAXIP1Q6ZW49 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PAXIP1Q6ZW49 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PAXIP1Q6ZW49 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PAXIP1Q6ZW49 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PAXIP1Q6ZW49 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PAXIP1Q6ZW49 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PAXIP1Q6ZW49 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PAXIP1Q6ZW49 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PAXIP1Q6ZW49 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PAXIP1Q6ZW49 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PAXIP1Q6ZW49 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PAXIP1Q6ZW49 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PAXIP1Q6ZW49 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PAXIP1Q6ZW49 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PAXIP1Q6ZW49 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PAXIP1Q6ZW49 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PAXIP1Q6ZW49 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PAXIP1Q6ZW49 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PAXIP1Q6ZW49 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PAXIP1Q6ZW49 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PAXIP1Q6ZW49 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PAXIP1Q6ZW49 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PAXIP1Q6ZW49 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PAXIP1Q6ZW49 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PAXIP1Q6ZW49 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PAXIP1Q6ZW49 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PAXIP1Q6ZW49 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PAXIP1Q6ZW49 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PAXIP1Q6ZW49 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PAXIP1Q6ZW49 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PAXIP1Q6ZW49 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PAXIP1Q6ZW49 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PAXIP1Q6ZW49 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PAXIP1Q6ZW49 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PAXIP1Q6ZW49 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms