Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSI9

CAPN12, Calpain-12, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN12Q6ZSI9 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPN12Q6ZSI9 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPN12Q6ZSI9 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPN12Q6ZSI9 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPN12Q6ZSI9 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPN12Q6ZSI9 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPN12Q6ZSI9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPN12Q6ZSI9 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPN12Q6ZSI9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPN12Q6ZSI9 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPN12Q6ZSI9 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPN12Q6ZSI9 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPN12Q6ZSI9 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPN12Q6ZSI9 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPN12Q6ZSI9 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPN12Q6ZSI9 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPN12Q6ZSI9 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPN12Q6ZSI9 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPN12Q6ZSI9 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPN12Q6ZSI9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPN12Q6ZSI9 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPN12Q6ZSI9 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPN12Q6ZSI9 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPN12Q6ZSI9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPN12Q6ZSI9 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPN12Q6ZSI9 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPN12Q6ZSI9 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPN12Q6ZSI9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPN12Q6ZSI9 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN12Q6ZSI9 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN12Q6ZSI9 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN12Q6ZSI9 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN12Q6ZSI9 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN12Q6ZSI9 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN12Q6ZSI9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN12Q6ZSI9 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN12Q6ZSI9 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN12Q6ZSI9 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN12Q6ZSI9 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN12Q6ZSI9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN12Q6ZSI9 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN12Q6ZSI9 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN12Q6ZSI9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN12Q6ZSI9 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN12Q6ZSI9 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN12Q6ZSI9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN12Q6ZSI9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN12Q6ZSI9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN12Q6ZSI9 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN12Q6ZSI9 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN12Q6ZSI9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN12Q6ZSI9 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN12Q6ZSI9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN12Q6ZSI9 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN12Q6ZSI9 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN12Q6ZSI9 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN12Q6ZSI9 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN12Q6ZSI9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CAPN12Q6ZSI9 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CAPN12Q6ZSI9 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CAPN12Q6ZSI9 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPN12Q6ZSI9 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPN12Q6ZSI9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPN12Q6ZSI9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPN12Q6ZSI9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPN12Q6ZSI9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPN12Q6ZSI9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPN12Q6ZSI9 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPN12Q6ZSI9 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPN12Q6ZSI9 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPN12Q6ZSI9 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPN12Q6ZSI9 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPN12Q6ZSI9 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPN12Q6ZSI9 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPN12Q6ZSI9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPN12Q6ZSI9 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPN12Q6ZSI9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPN12Q6ZSI9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPN12Q6ZSI9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPN12Q6ZSI9 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPN12Q6ZSI9 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPN12Q6ZSI9 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPN12Q6ZSI9 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPN12Q6ZSI9 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPN12Q6ZSI9 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPN12Q6ZSI9 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN12Q6ZSI9 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN12Q6ZSI9 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN12Q6ZSI9 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN12Q6ZSI9 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN12Q6ZSI9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN12Q6ZSI9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN12Q6ZSI9 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN12Q6ZSI9 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN12Q6ZSI9 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN12Q6ZSI9 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN12Q6ZSI9 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN12Q6ZSI9 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN12Q6ZSI9 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN12Q6ZSI9 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms